More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1491 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  77.44 
 
 		 498 aa  815    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  71.75 
 
 		 499 aa  731    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  67.68 
 
 		 495 aa  719    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  64.42 
 
 		 486 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  69.51 
 
 		 495 aa  723    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1491  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 495 aa  1029    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  52.43 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  48.12 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  52.42 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  52.42 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  45.01 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  43.88 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  43.43 
 
 		 478 aa  362  9e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  42.54 
 
 		 484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  41.94 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  43.03 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  42.69 
 
 		 479 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  41.75 
 
 		 493 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  39.81 
 
 		 539 aa  348  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  38.61 
 
 		 514 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  40.31 
 
 		 529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  40.31 
 
 		 529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  39.35 
 
 		 529 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  39.54 
 
 		 529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.01 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1671  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.54 
 
 		 529 aa  333  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  37.43 
 
 		 530 aa  331  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  38.36 
 
 		 537 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  41.68 
 
 		 486 aa  329  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.17 
 
 		 530 aa  306  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  32.34 
 
 		 490 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  30.39 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  29.68 
 
 		 489 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  29.65 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  30.35 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  31.78 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.69 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  31.46 
 
 		 481 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  31.01 
 
 		 486 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  29.45 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  28.6 
 
 		 494 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  28.41 
 
 		 553 aa  147  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  29.42 
 
 		 488 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.85 
 
 		 484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  27.68 
 
 		 503 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  27.97 
 
 		 553 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  29.35 
 
 		 484 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  30.75 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  29.15 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  30.25 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  30.12 
 
 		 479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  28.72 
 
 		 501 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  27.82 
 
 		 499 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.48 
 
 		 703 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  29.94 
 
 		 500 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  30.38 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  30.06 
 
 		 490 aa  136  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  26.71 
 
 		 527 aa  136  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  29.41 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  30.7 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  31.27 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  30.05 
 
 		 549 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  26.73 
 
 		 484 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  30.77 
 
 		 506 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  28.47 
 
 		 481 aa  133  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  28.05 
 
 		 554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  26.46 
 
 		 579 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  30.58 
 
 		 489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  30.85 
 
 		 519 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  30.65 
 
 		 485 aa  131  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  29.38 
 
 		 544 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  29.38 
 
 		 544 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  27.36 
 
 		 484 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  30.51 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  31.01 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  26.44 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  28.42 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.47 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  29.41 
 
 		 544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  26.84 
 
 		 512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  30.88 
 
 		 545 aa  128  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  30.89 
 
 		 489 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  29.32 
 
 		 504 aa  127  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  27.85 
 
 		 524 aa  127  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  28.13 
 
 		 540 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.17 
 
 		 504 aa  126  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  27.65 
 
 		 710 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  29.05 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  28.47 
 
 		 571 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  25.71 
 
 		 489 aa  126  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  25.84 
 
 		 808 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  29.43 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  25.62 
 
 		 809 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  27.36 
 
 		 810 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  28.75 
 
 		 505 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  25.66 
 
 		 509 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  30.4 
 
 		 489 aa  123  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  30.4 
 
 		 489 aa  123  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  28.3 
 
 		 481 aa  123  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 508 aa  123  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>