More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3269 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  64.75 
 
 		 486 aa  663    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  100 
 
 		 498 aa  1036    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  71.89 
 
 		 499 aa  738    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  66.87 
 
 		 495 aa  709    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1491  N-6 DNA methylase  77.44 
 
 		 495 aa  830    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  67.01 
 
 		 495 aa  719    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  52.9 
 
 		 494 aa  522  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  50 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  53.42 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  53.42 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  43.81 
 
 		 481 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  43.06 
 
 		 493 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  44.49 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  43.57 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  42.86 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  42.8 
 
 		 479 aa  362  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  41.73 
 
 		 477 aa  360  4e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  40.75 
 
 		 533 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  39.33 
 
 		 539 aa  354  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  39.72 
 
 		 514 aa  350  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  42.07 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  39.29 
 
 		 529 aa  346  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  39.47 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  39.47 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  39.47 
 
 		 529 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  37.64 
 
 		 530 aa  340  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1671  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  39.77 
 
 		 529 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  37.96 
 
 		 537 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  41.55 
 
 		 486 aa  333  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.69 
 
 		 530 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  31.6 
 
 		 490 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  30.6 
 
 		 492 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  32.47 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  27.97 
 
 		 553 aa  160  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  31.43 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  27.34 
 
 		 553 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  31.04 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  30.4 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  34.46 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.77 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  29.98 
 
 		 703 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  29.49 
 
 		 493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  30.98 
 
 		 493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.85 
 
 		 484 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  30.1 
 
 		 501 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  33.02 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  32.72 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  29.16 
 
 		 506 aa  150  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  28.6 
 
 		 484 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  29.13 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  30.34 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  30.52 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  31.84 
 
 		 513 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  31.32 
 
 		 489 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  26.57 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  27.81 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  32.26 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  32.51 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  32.49 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  29.41 
 
 		 489 aa  143  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  29.41 
 
 		 489 aa  143  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  30.2 
 
 		 479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  29.76 
 
 		 500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  29.57 
 
 		 481 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  27.74 
 
 		 509 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  31.21 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  29.41 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  28.87 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  29.39 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  24.76 
 
 		 579 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  30.73 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  26.96 
 
 		 489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  30.77 
 
 		 493 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  28.22 
 
 		 495 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  29.78 
 
 		 519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  31.04 
 
 		 710 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  28.36 
 
 		 544 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  29.98 
 
 		 563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  27.17 
 
 		 570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  29.03 
 
 		 544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  28.61 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  30.13 
 
 		 544 aa  134  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  30.52 
 
 		 524 aa  134  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  28.25 
 
 		 527 aa  134  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  27.87 
 
 		 505 aa  133  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  25.99 
 
 		 809 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  25.67 
 
 		 810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  28.68 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  29.43 
 
 		 540 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  27.6 
 
 		 571 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  29.88 
 
 		 512 aa  130  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  29.04 
 
 		 484 aa  130  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  30.35 
 
 		 822 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.84 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  29.26 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  26.19 
 
 		 496 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  26.39 
 
 		 481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  27.92 
 
 		 500 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.87 
 
 		 504 aa  128  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  29.29 
 
 		 485 aa  127  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>