More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2418 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  100 
 
 
493 aa  1021    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  59.13 
 
 
506 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  56.91 
 
 
484 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  55.6 
 
 
512 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  52.41 
 
 
513 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  53.36 
 
 
516 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  51.35 
 
 
517 aa  524  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  49.1 
 
 
548 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  52.86 
 
 
504 aa  509  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  46.17 
 
 
540 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  48.39 
 
 
524 aa  497  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  49.49 
 
 
489 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  49.41 
 
 
508 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  47.07 
 
 
527 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  49.8 
 
 
505 aa  472  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  46.62 
 
 
544 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  46.44 
 
 
544 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  61.46 
 
 
563 aa  468  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  47.02 
 
 
513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  45.89 
 
 
544 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  46.86 
 
 
506 aa  451  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  45.72 
 
 
545 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  46.46 
 
 
499 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  43.82 
 
 
554 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  43.27 
 
 
553 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  42.7 
 
 
570 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  41.94 
 
 
579 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  42.69 
 
 
553 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  43.19 
 
 
481 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  52.03 
 
 
1005 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  31.51 
 
 
549 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  35.86 
 
 
818 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  35.75 
 
 
775 aa  217  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  32.33 
 
 
846 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  32.48 
 
 
834 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  30 
 
 
490 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  28.4 
 
 
492 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  29.65 
 
 
492 aa  177  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.09 
 
 
530 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  26.93 
 
 
484 aa  177  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  28.54 
 
 
489 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  31.12 
 
 
501 aa  176  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  32.11 
 
 
500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  30.08 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  31.22 
 
 
493 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  27.24 
 
 
489 aa  170  6e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  28.18 
 
 
494 aa  169  8e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  27.66 
 
 
477 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  29.12 
 
 
500 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  26.85 
 
 
488 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  28.84 
 
 
484 aa  166  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  28.36 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  26.99 
 
 
486 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  30.7 
 
 
485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  27.66 
 
 
481 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  27.21 
 
 
481 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  26.6 
 
 
489 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  26.6 
 
 
489 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  31.43 
 
 
489 aa  161  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  25.61 
 
 
479 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  25.55 
 
 
509 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  27.67 
 
 
481 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  29.37 
 
 
489 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.31 
 
 
502 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  27.24 
 
 
710 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  28.4 
 
 
489 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  26.78 
 
 
488 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  30.57 
 
 
489 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  27.31 
 
 
489 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  27.59 
 
 
534 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.55 
 
 
703 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  26.65 
 
 
519 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  26.43 
 
 
493 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  30.45 
 
 
489 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  26.81 
 
 
484 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  27.75 
 
 
486 aa  150  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.29 
 
 
484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  27.84 
 
 
484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  28.95 
 
 
494 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  25.98 
 
 
495 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  27.39 
 
 
484 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  28.15 
 
 
481 aa  143  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  29.37 
 
 
478 aa  143  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  26.58 
 
 
523 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  26.58 
 
 
508 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  29.52 
 
 
479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  28.48 
 
 
484 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.22 
 
 
484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  30.93 
 
 
480 aa  139  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  28.51 
 
 
477 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  28.73 
 
 
539 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  37.4 
 
 
486 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  31.3 
 
 
484 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  27.61 
 
 
571 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  29.15 
 
 
486 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  31.03 
 
 
429 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  31.03 
 
 
429 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  34.09 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  34.09 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  27.74 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>