More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0389 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 818 aa  1682    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  39.25 
 
 		 505 aa  328  3e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  39.09 
 
 		 499 aa  320  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  37.3 
 
 		 553 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  37.23 
 
 		 554 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  36.71 
 
 		 553 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  35.36 
 
 		 489 aa  301  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  38.27 
 
 		 508 aa  296  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  36.17 
 
 		 570 aa  295  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  37.25 
 
 		 527 aa  293  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  33.46 
 
 		 579 aa  291  4e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  35.7 
 
 		 545 aa  291  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  36.72 
 
 		 513 aa  289  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  38.62 
 
 		 544 aa  287  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  38.62 
 
 		 544 aa  287  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  37.38 
 
 		 544 aa  286  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.98 
 
 		 504 aa  286  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  37.24 
 
 		 484 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  34.91 
 
 		 517 aa  285  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  35.17 
 
 		 506 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  35.56 
 
 		 540 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  35.06 
 
 		 506 aa  276  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.85 
 
 		 548 aa  264  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  35.86 
 
 		 493 aa  258  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  34.02 
 
 		 513 aa  255  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  35.65 
 
 		 563 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  34.42 
 
 		 512 aa  250  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  34.15 
 
 		 524 aa  250  8e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  33.54 
 
 		 549 aa  249  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  39.83 
 
 		 1005 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  35.11 
 
 		 481 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  35.21 
 
 		 516 aa  232  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  35.78 
 
 		 775 aa  198  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  37.34 
 
 		 846 aa  192  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  30.13 
 
 		 834 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  29.84 
 
 		 494 aa  180  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  29.53 
 
 		 492 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  29.72 
 
 		 481 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  27.46 
 
 		 484 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  29.41 
 
 		 489 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  29.74 
 
 		 489 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  28.33 
 
 		 492 aa  149  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  28.94 
 
 		 489 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  29.49 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  27.82 
 
 		 489 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.25 
 
 		 502 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  28.16 
 
 		 485 aa  144  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  28.5 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  29.04 
 
 		 488 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  28.34 
 
 		 488 aa  140  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  28.6 
 
 		 490 aa  140  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  28.05 
 
 		 486 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  27.45 
 
 		 519 aa  139  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  27.71 
 
 		 493 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.41 
 
 		 703 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  28.93 
 
 		 490 aa  137  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  26.53 
 
 		 489 aa  135  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  26.53 
 
 		 489 aa  135  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 		 500 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  27.65 
 
 		 495 aa  135  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  27.9 
 
 		 503 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  27.96 
 
 		 484 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  28.1 
 
 		 493 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  27.06 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  29.02 
 
 		 571 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  27.5 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  26.91 
 
 		 479 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  26.79 
 
 		 501 aa  132  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  27.79 
 
 		 493 aa  132  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  26.08 
 
 		 489 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  28.75 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.86 
 
 		 484 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  28.04 
 
 		 539 aa  127  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  31.76 
 
 		 534 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.63 
 
 		 484 aa  127  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  29.28 
 
 		 481 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 		 496 aa  125  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  29.9 
 
 		 710 aa  124  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  26.23 
 
 		 486 aa  124  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  26.6 
 
 		 484 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  27.42 
 
 		 504 aa  122  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  28.48 
 
 		 824 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  28.66 
 
 		 481 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  28.5 
 
 		 891 aa  121  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27.79 
 
 		 498 aa  120  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  29.28 
 
 		 509 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  27.67 
 
 		 484 aa  120  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  27.51 
 
 		 484 aa  120  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  28.18 
 
 		 495 aa  120  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  26.39 
 
 		 484 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  27.51 
 
 		 633 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  28.21 
 
 		 529 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  28.21 
 
 		 529 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.46 
 
 		 505 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.8 
 
 		 533 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  30.58 
 
 		 822 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  28 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  28.66 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  31.4 
 
 		 808 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  26.52 
 
 		 508 aa  115  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>