169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1514 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  100 
 
 		 466 aa  919    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  41.52 
 
 		 478 aa  346  4e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  30.98 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  28.97 
 
 		 557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  30.12 
 
 		 629 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  28.11 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  24.83 
 
 		 493 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1426 aa  86.7  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  24.69 
 
 		 1432 aa  83.6  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.54 
 
 		 974 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  32.74 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  28.73 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  27.39 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.14 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.86 
 
 		 836 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  23.18 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  29.37 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  26.47 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2786  hypothetical protein  26.51 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1154 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  26.64 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  23.34 
 
 		 527 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  35.24 
 
 		 1036 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  27.15 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1338 aa  64.7  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1612 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  24.89 
 
 		 746 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  30.81 
 
 		 573 aa  63.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  28.15 
 
 		 523 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  23.79 
 
 		 995 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  32.11 
 
 		 652 aa  62.4  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  29.33 
 
 		 527 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1299 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  21.82 
 
 		 1076 aa  60.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  31.34 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  28.65 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  24.88 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1209 aa  58.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  23.83 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  32.14 
 
 		 1186 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  24.77 
 
 		 238 aa  57  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  24.07 
 
 		 481 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1748 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  22.39 
 
 		 570 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.65 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  23.76 
 
 		 1132 aa  55.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1177 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  32.6 
 
 		 587 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  27.41 
 
 		 552 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.73 
 
 		 295 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 1700 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  20.32 
 
 		 521 aa  54.7  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 658 aa  54.7  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 1516 aa  53.9  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2532  hypothetical protein  28.98 
 
 		 497 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.928699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1697 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1178 aa  53.5  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1120 aa  53.5  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  28.88 
 
 		 299 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  20.21 
 
 		 1159 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  34.53 
 
 		 1701 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  27.14 
 
 		 262 aa  53.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3772  type II restriction enzyme NspV-like protein  26.96 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3822  modification methylase NspV  26.96 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  33.59 
 
 		 1417 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1231 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  30.43 
 
 		 1669 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  25 
 
 		 950 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.06 
 
 		 289 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  30.95 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1209 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.16 
 
 		 579 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  30.46 
 
 		 1702 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  28.35 
 
 		 1167 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  30.81 
 
 		 1703 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  29.55 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  27.8 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  31.3 
 
 		 1697 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  27.54 
 
 		 553 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  31.03 
 
 		 626 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.87 
 
 		 297 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 1642 aa  50.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1147 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 450 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  30.77 
 
 		 1058 aa  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  31.3 
 
 		 1257 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  25.11 
 
 		 563 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  30.51 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  32.18 
 
 		 677 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1218  N-6 DNA methylase  23.78 
 
 		 544 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  40.48 
 
 		 816 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1210 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  27.88 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 577 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 260 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  28.25 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  27.7 
 
 		 1606 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 		 1693 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.43 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>