82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2385 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1046    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  62.07 
 
 		 557 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  53.08 
 
 		 562 aa  554  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  25.86 
 
 		 995 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  26.62 
 
 		 1432 aa  136  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  29.55 
 
 		 466 aa  123  8e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1036 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  23.76 
 
 		 1076 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  27.06 
 
 		 478 aa  114  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1177 aa  110  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  22.28 
 
 		 974 aa  107  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  28.21 
 
 		 629 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1154 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1426 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1612 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  20.99 
 
 		 410 aa  95.1  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  21.81 
 
 		 1132 aa  93.6  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1299 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  25.88 
 
 		 455 aa  92.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1147 aa  90.1  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  26.23 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1209 aa  88.2  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  20.57 
 
 		 836 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  21.09 
 
 		 1120 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.08 
 
 		 1244 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  21.91 
 
 		 1257 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1338 aa  80.1  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.64 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  20.52 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  21.61 
 
 		 1159 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.17 
 
 		 694 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  22.16 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  22.76 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  20.13 
 
 		 1252 aa  67.4  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  19.91 
 
 		 1256 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  23.56 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  25.07 
 
 		 1189 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  19.13 
 
 		 1058 aa  59.7  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  25.11 
 
 		 1239 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.8 
 
 		 950 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1209 aa  56.6  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  23.28 
 
 		 523 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1210 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  18.05 
 
 		 1170 aa  53.9  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25.43 
 
 		 595 aa  53.9  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1233 aa  53.5  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1104 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  23.28 
 
 		 908 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1231 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  25.26 
 
 		 652 aa  51.6  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  22.29 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1497 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1195 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  21.59 
 
 		 1222 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  27.91 
 
 		 495 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  30 
 
 		 1184 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1282 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  26.82 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  28.24 
 
 		 552 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  16.94 
 
 		 1186 aa  49.3  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1241 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  21.31 
 
 		 404 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1182 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  26.26 
 
 		 578 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.11 
 
 		 1020 aa  47.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1178 aa  47.4  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  26.04 
 
 		 522 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  36 
 
 		 1174 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1171 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  34.86 
 
 		 684 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24 
 
 		 1041 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  24.41 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  26.95 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  25 
 
 		 1183 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  32.39 
 
 		 926 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  28.81 
 
 		 731 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  36.36 
 
 		 389 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  31.25 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  28.82 
 
 		 604 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1231 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  25.2 
 
 		 612 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0523  hypothetical protein  65.52 
 
 		 148 aa  43.5  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>