98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0228 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  100 
 
 		 652 aa  1321    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  27.65 
 
 		 1058 aa  274  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  31.11 
 
 		 1256 aa  232  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  29.02 
 
 		 1252 aa  213  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.02 
 
 		 1020 aa  157  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  22.5 
 
 		 974 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1147 aa  94.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.54 
 
 		 995 aa  94  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.94 
 
 		 416 aa  94  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  21.92 
 
 		 1159 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  26.94 
 
 		 1041 aa  84  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  29.35 
 
 		 816 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1036 aa  77.8  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1299 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.36 
 
 		 836 aa  74.7  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  24.88 
 
 		 1089 aa  74.3  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  28.12 
 
 		 792 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1209 aa  72  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1177 aa  69.7  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  22.2 
 
 		 570 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  31.11 
 
 		 1257 aa  67.8  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  19.89 
 
 		 1170 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.77 
 
 		 1076 aa  67.8  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  30.37 
 
 		 1244 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  32.38 
 
 		 527 aa  66.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1612 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  22.92 
 
 		 746 aa  64.7  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1154 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  27.56 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.47 
 
 		 950 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  32.11 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  34.93 
 
 		 1422 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  20.78 
 
 		 1125 aa  61.6  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1338 aa  60.8  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  22.88 
 
 		 1132 aa  60.1  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1178 aa  59.7  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1120 aa  58.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1243 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  22.16 
 
 		 1186 aa  55.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.44 
 
 		 1194 aa  54.3  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  20.12 
 
 		 405 aa  54.3  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  29.57 
 
 		 629 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1039 aa  54.3  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  23 
 
 		 554 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1104 aa  53.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  22.61 
 
 		 748 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1426 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1339 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  23.28 
 
 		 484 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  21.45 
 
 		 1432 aa  51.6  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.95 
 
 		 484 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.43 
 
 		 484 aa  51.2  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  28.57 
 
 		 1712 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1298 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  21.72 
 
 		 826 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1209 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  26.26 
 
 		 1189 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1321 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  22.34 
 
 		 570 aa  48.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  30.33 
 
 		 1219 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1171 aa  48.5  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1282 aa  48.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  35 
 
 		 1338 aa  47.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  23.28 
 
 		 484 aa  47.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  23.28 
 
 		 484 aa  47.4  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  31.82 
 
 		 486 aa  47.4  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  26.13 
 
 		 404 aa  47.4  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  28.26 
 
 		 1319 aa  47.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  29.51 
 
 		 495 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1484 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  25.35 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  30.77 
 
 		 1180 aa  47.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  21.54 
 
 		 694 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1425 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  26.23 
 
 		 518 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.63 
 
 		 1002 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  27.39 
 
 		 489 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  23.94 
 
 		 579 aa  46.6  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  25.66 
 
 		 1222 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  28.87 
 
 		 1183 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1184 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  29.71 
 
 		 1331 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1162 aa  45.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1290 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2939  N-6 DNA methylase  23.68 
 
 		 926 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  24.14 
 
 		 908 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  23.04 
 
 		 882 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  27.63 
 
 		 1343 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  26.44 
 
 		 612 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1347 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  31.76 
 
 		 1336 aa  45.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1182 aa  44.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  24.65 
 
 		 552 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1497 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  22.77 
 
 		 493 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1218 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1195 aa  43.9  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  28.98 
 
 		 513 aa  43.9  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>