75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0279 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  41.18 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  27.4 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  30.84 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  30.26 
 
 		 552 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  37.19 
 
 		 1697 aa  59.7  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 658 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  23.18 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  39.78 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  36.52 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1748 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  33.07 
 
 		 1417 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  30.26 
 
 		 670 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  29.01 
 
 		 1693 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  36.07 
 
 		 1700 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  37.37 
 
 		 489 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  27.8 
 
 		 466 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  36.17 
 
 		 389 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 1516 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  33.33 
 
 		 1697 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  37.04 
 
 		 527 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  32.23 
 
 		 1703 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  27.65 
 
 		 1414 aa  48.9  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  34.35 
 
 		 481 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  26.23 
 
 		 595 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  24.79 
 
 		 493 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  34.58 
 
 		 1722 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  27.51 
 
 		 521 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  25 
 
 		 495 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  25.48 
 
 		 660 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  24.79 
 
 		 489 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  24.48 
 
 		 633 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0857  N-6 DNA methylase  45.1 
 
 		 495 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.015495  normal  0.121553 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  28.41 
 
 		 655 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  22.78 
 
 		 495 aa  46.2  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0819  hypothetical protein  25.83 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  29.27 
 
 		 553 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.657325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2478  N-6 DNA methylase  47.92 
 
 		 881 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  38.75 
 
 		 1925 aa  45.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  27.45 
 
 		 523 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  24.08 
 
 		 489 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2366  hypothetical protein  30.43 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.04 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 1594 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  24.34 
 
 		 527 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  22.5 
 
 		 533 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0144  hypothetical protein  25.88 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  32.8 
 
 		 1702 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 577 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4725  hypothetical protein  41.07 
 
 		 1022 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  25.71 
 
 		 479 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  23.86 
 
 		 563 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  24.18 
 
 		 522 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  32.26 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2222  hypothetical protein  31.88 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168319  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  23.45 
 
 		 526 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  23.83 
 
 		 503 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  33.06 
 
 		 1701 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  30.77 
 
 		 501 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  37.68 
 
 		 407 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  31.3 
 
 		 493 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00110  rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase, putative  31.13 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0222331  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  21.77 
 
 		 480 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0974  hypothetical protein  31.16 
 
 		 369 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.85 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  29.58 
 
 		 470 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  30 
 
 		 673 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  24.59 
 
 		 478 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  23.41 
 
 		 481 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  30.53 
 
 		 495 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  37.5 
 
 		 568 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1201  N-6 DNA methylase  43.14 
 
 		 499 aa  42  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>