144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3619 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  100 
 
 		 450 aa  931    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  81.29 
 
 		 449 aa  747    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  36.49 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  40.48 
 
 		 557 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  37.43 
 
 		 658 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.1 
 
 		 254 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  27.31 
 
 		 660 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  35.03 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  32.56 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 569 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  39.42 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  25.77 
 
 		 313 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  29.11 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  29.11 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  29.11 
 
 		 187 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.57 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  29.01 
 
 		 548 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  31.87 
 
 		 836 aa  56.6  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  32.42 
 
 		 836 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3661  hypothetical protein  26.15 
 
 		 268 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  27.12 
 
 		 1421 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  32.65 
 
 		 206 aa  53.5  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  28.1 
 
 		 552 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  27.63 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  30.68 
 
 		 527 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  31.69 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  29.75 
 
 		 597 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3689  hypothetical protein  23.92 
 
 		 268 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0182  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  51.2  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  32.48 
 
 		 554 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  31.55 
 
 		 466 aa  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 252 aa  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  28.57 
 
 		 1722 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  35.42 
 
 		 185 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  32.94 
 
 		 206 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  36.11 
 
 		 195 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  29.32 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0711  hypothetical protein  28.7 
 
 		 188 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.23 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0531  methionine biosynthesis protein MetW  28.06 
 
 		 200 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  32.11 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.23 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 1516 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  28.24 
 
 		 197 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 995 aa  47.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  29.71 
 
 		 2570 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  27.27 
 
 		 204 aa  47.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0004  N-6 DNA methylase  28.16 
 
 		 710 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.702722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2729  hypothetical protein  25.98 
 
 		 327 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000436678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0736  N-6 DNA methylase  28.19 
 
 		 725 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0698793  normal  0.0155301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.52 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  31.58 
 
 		 1414 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 353 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  27.05 
 
 		 353 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1055  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.06 
 
 		 413 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.910912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.31 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  35.29 
 
 		 204 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2368  methyltransferase type 12  31.73 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1366  hypothetical protein  28.93 
 
 		 220 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.229777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 225 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1748 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  26.73 
 
 		 1697 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 274 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  26 
 
 		 1697 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1209  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.73 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.22 
 
 		 300 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 1700 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  26.24 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  23.21 
 
 		 574 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3067  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.62 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0799904  normal  0.0471962 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  27.73 
 
 		 311 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 211 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  29.67 
 
 		 185 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 1674 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 260 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  28.28 
 
 		 1635 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  23.63 
 
 		 574 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  30.28 
 
 		 304 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.11 
 
 		 256 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.99 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0203471  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  24.21 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 221 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.43 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  29.41 
 
 		 206 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  31.76 
 
 		 199 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  42.31 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  29.24 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  24.48 
 
 		 809 aa  44.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  29.35 
 
 		 195 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.43 
 
 		 300 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.78 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2254  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.3 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.43 
 
 		 300 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3573  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.79 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.716424  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>