More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0736 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0736  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 725 aa  1471    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0698793  normal  0.0155301 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2987  N-6 DNA methylase  39.15 
 
 		 692 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2085  N-6 DNA methylase  35.41 
 
 		 711 aa  240  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000172006 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5275  N-6 DNA methylase  45.31 
 
 		 623 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  28.76 
 
 		 775 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  29.09 
 
 		 834 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  30.92 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  30.08 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  28.74 
 
 		 506 aa  104  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1059  N-6 DNA methylase  31.56 
 
 		 516 aa  103  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  30.27 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  25.87 
 
 		 499 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  30.67 
 
 		 494 aa  101  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  30.94 
 
 		 502 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 553 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 553 aa  99.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  29.96 
 
 		 846 aa  98.6  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  30.32 
 
 		 489 aa  99  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  32.79 
 
 		 563 aa  98.6  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  30.3 
 
 		 484 aa  98.2  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  28.63 
 
 		 508 aa  97.8  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  27.05 
 
 		 554 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  28.77 
 
 		 544 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  26.54 
 
 		 505 aa  96.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3541  N-6 DNA methylase  29.22 
 
 		 524 aa  97.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  28.3 
 
 		 579 aa  96.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  28.77 
 
 		 544 aa  95.9  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  29 
 
 		 488 aa  94.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  26.64 
 
 		 544 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  28.68 
 
 		 493 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1436  N-6 DNA methylase  26 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  25.54 
 
 		 489 aa  91.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  27.99 
 
 		 506 aa  91.3  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.59 
 
 		 503 aa  91.3  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  28.25 
 
 		 488 aa  90.9  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0898  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.24 
 
 		 504 aa  90.9  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000642099  hitchhiker  0.000000156294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  25.63 
 
 		 540 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  26.47 
 
 		 570 aa  90.1  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  30.92 
 
 		 481 aa  89.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.07 
 
 		 548 aa  89.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  26.89 
 
 		 527 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  31.02 
 
 		 515 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  26.91 
 
 		 527 aa  88.6  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  26.4 
 
 		 545 aa  88.6  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  31.88 
 
 		 522 aa  88.6  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  29.33 
 
 		 710 aa  88.2  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  25.86 
 
 		 513 aa  87.4  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  29.79 
 
 		 493 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  30.53 
 
 		 489 aa  87.4  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  28.1 
 
 		 479 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  27.21 
 
 		 549 aa  87  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  28.81 
 
 		 493 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  28.29 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  26.84 
 
 		 730 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  28.63 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  28.46 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  29.86 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  30.74 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  23.36 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  31.34 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  28.68 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  25.58 
 
 		 1005 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  26.84 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  23.16 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  26.76 
 
 		 585 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0389  N-6 DNA methylase  26.2 
 
 		 818 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  28.4 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  28.46 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  29.53 
 
 		 480 aa  83.2  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  28.27 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  28.89 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  27.62 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  31.67 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  31.34 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  30 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  27.74 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  29.79 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  27 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  29.46 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  31.25 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  25.91 
 
 		 477 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  29.49 
 
 		 515 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  26.76 
 
 		 518 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  29.96 
 
 		 534 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.45 
 
 		 703 aa  79.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  28.88 
 
 		 873 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  28.76 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  29.12 
 
 		 514 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  29.95 
 
 		 554 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  27.02 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  26.72 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  29.49 
 
 		 523 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  27.96 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  28.44 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.44 
 
 		 574 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  29.13 
 
 		 574 aa  78.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  30.32 
 
 		 574 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 816 aa  78.2  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  30.09 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  28.63 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>