More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0182 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0182  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  316  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1368  hypothetical protein  43.79 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  39.63 
 
 
186 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  38.99 
 
 
178 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  31.87 
 
 
182 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1108  hypothetical protein  36.36 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.347631  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  36.59 
 
 
178 aa  98.2  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  37.04 
 
 
184 aa  97.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  32.92 
 
 
186 aa  97.4  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  38.41 
 
 
182 aa  97.1  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  34.94 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  38.27 
 
 
178 aa  94  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  35.4 
 
 
178 aa  93.6  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  38.55 
 
 
189 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  36.97 
 
 
185 aa  92.8  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  33.13 
 
 
192 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  35.54 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  36.02 
 
 
179 aa  91.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  34.16 
 
 
182 aa  91.7  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  37.27 
 
 
210 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  32.48 
 
 
180 aa  90.9  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  35.22 
 
 
185 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  35.22 
 
 
185 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  34.34 
 
 
193 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  33.94 
 
 
207 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  33.95 
 
 
177 aa  87.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  87.4  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  34.38 
 
 
184 aa  87  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  38.61 
 
 
205 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  35.19 
 
 
193 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  32.74 
 
 
186 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  34.92 
 
 
218 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  34.92 
 
 
218 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  30.43 
 
 
187 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  31.93 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  31.74 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  35.88 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  33.54 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1527  methyltransferase  32.72 
 
 
179 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  31.25 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  34.36 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4018  hypothetical protein  29.27 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  34.97 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  33.75 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0191  hypothetical protein  33.73 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.644912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  35.5 
 
 
183 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  31.95 
 
 
188 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  33.74 
 
 
187 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  32.3 
 
 
187 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  33.73 
 
 
184 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  33.92 
 
 
189 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  32.8 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1441  methyltransferase  31.61 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0718  hypothetical protein  30.82 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  34.55 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  29.09 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  34.55 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1395  putative methyltransferase  31.61 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  37.98 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  37.98 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 
202 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  35.16 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  32.9 
 
 
205 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  31.55 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  34.68 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  35.33 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09101  N6-adenine-specific methylase  30.06 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.683798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1500  methyltransferase  30.86 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  32.95 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0565  putative methyltransferase  33.77 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000647034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  31.9 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1480  hypothetical protein  28.03 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  37.88 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2142  methyltransferase  29.01 
 
 
195 aa  77.4  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  37.88 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  26.71 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  35.29 
 
 
187 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  28.29 
 
 
211 aa  77.4  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  34.73 
 
 
185 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  31.71 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  31.21 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.33 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  30.99 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  28.57 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  28.4 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15271  N6-adenine-specific methylase  30.9 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  32.12 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  29.76 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  33.54 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  33.72 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  33.53 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0493  methyltransferase  34.23 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  33.54 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6231  hypothetical protein  32.5 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  30.49 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  30.07 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  36.22 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  30.12 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>