More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2085 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  54.4 
 
 
189 aa  185  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  44.75 
 
 
183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  45.11 
 
 
210 aa  171  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  45.05 
 
 
192 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  41.99 
 
 
186 aa  158  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  46.15 
 
 
189 aa  158  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  40.33 
 
 
188 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  40.88 
 
 
188 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  40.88 
 
 
188 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  42.86 
 
 
187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  45.83 
 
 
194 aa  154  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  40.33 
 
 
188 aa  154  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  39.23 
 
 
188 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  39.23 
 
 
188 aa  153  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  43.65 
 
 
185 aa  153  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  43.65 
 
 
185 aa  153  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  42.39 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  41.85 
 
 
187 aa  151  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  40.11 
 
 
198 aa  151  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  38.67 
 
 
188 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  38.67 
 
 
188 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  38.67 
 
 
188 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  42.31 
 
 
187 aa  149  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  38.67 
 
 
188 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  40.76 
 
 
187 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  45.86 
 
 
183 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  38.67 
 
 
188 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  42.7 
 
 
207 aa  147  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  39.78 
 
 
189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  41.3 
 
 
187 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  40.11 
 
 
188 aa  144  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  39.23 
 
 
183 aa  143  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  43.41 
 
 
193 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  43.48 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  38.89 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  42.25 
 
 
191 aa  137  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  41.53 
 
 
198 aa  137  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  43.41 
 
 
193 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  39.13 
 
 
207 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  43.89 
 
 
179 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  43.89 
 
 
179 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  43.89 
 
 
179 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  38.55 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  41.85 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  37.57 
 
 
184 aa  131  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  38.67 
 
 
184 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  37.02 
 
 
184 aa  131  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  37.91 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  37.91 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  36.11 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  40.32 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2064  putative methyltransferase  40.78 
 
 
179 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371862  normal  0.712405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  38.73 
 
 
192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.46 
 
 
220 aa  128  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.46 
 
 
220 aa  127  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.46 
 
 
220 aa  127  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  37.57 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  35.16 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  38.92 
 
 
205 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  38.25 
 
 
191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  37.11 
 
 
197 aa  124  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  43.05 
 
 
185 aa  124  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1881  methyltransferase, putative  35.91 
 
 
183 aa  123  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.752838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4018  hypothetical protein  39.53 
 
 
184 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  37.7 
 
 
191 aa  123  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  40.66 
 
 
185 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  32.78 
 
 
186 aa  121  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.5 
 
 
207 aa  121  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  41.08 
 
 
188 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  37.5 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  39.89 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  36.96 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  43.56 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  39.46 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  36.57 
 
 
180 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  35.52 
 
 
192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  35.14 
 
 
211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  36.76 
 
 
185 aa  118  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0307  methyltransferase  35.26 
 
 
226 aa  117  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499795  hitchhiker  0.00000453618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.11 
 
 
199 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1070  hypothetical protein  38.83 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  37.02 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  33.7 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  40.44 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  36.41 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1433  putative methyltransferase  35.05 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  39.57 
 
 
191 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  36.46 
 
 
189 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  38.38 
 
 
187 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2142  putative methyltransferase  38.73 
 
 
182 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308596  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  34.81 
 
 
198 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  37.08 
 
 
180 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  37.08 
 
 
180 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  37.97 
 
 
196 aa  114  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  35.52 
 
 
200 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.11 
 
 
191 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  37.3 
 
 
180 aa  114  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  38.95 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>