More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1185 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  65.17 
 
 
178 aa  260  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  65.73 
 
 
178 aa  249  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  61.02 
 
 
184 aa  230  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  60.11 
 
 
178 aa  229  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  53.89 
 
 
182 aa  201  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  48.86 
 
 
177 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  34.64 
 
 
178 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  33.52 
 
 
182 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  35.83 
 
 
186 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  36.67 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  31.28 
 
 
179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  35.84 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  32.79 
 
 
180 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  32.2 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  36.32 
 
 
190 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  32.26 
 
 
187 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  33.7 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  33.89 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  32.78 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  37.1 
 
 
186 aa  109  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  34.57 
 
 
190 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  34.68 
 
 
208 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  37.3 
 
 
186 aa  107  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  35.52 
 
 
186 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  32.4 
 
 
182 aa  105  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  36.14 
 
 
187 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  33.33 
 
 
207 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  37.82 
 
 
189 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  31.22 
 
 
188 aa  104  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  30.69 
 
 
188 aa  103  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  30.69 
 
 
188 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  34.41 
 
 
186 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  34.24 
 
 
185 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  35.45 
 
 
189 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  32.07 
 
 
189 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  30.16 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  31.52 
 
 
210 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  30.98 
 
 
180 aa  101  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  29.61 
 
 
202 aa  101  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  34.43 
 
 
185 aa  101  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  34.43 
 
 
185 aa  101  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  32.45 
 
 
191 aa  101  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  30.81 
 
 
198 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  32.91 
 
 
181 aa  100  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  29.63 
 
 
188 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  29.63 
 
 
188 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  29.63 
 
 
188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  34.08 
 
 
184 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  35.2 
 
 
184 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0565  putative methyltransferase  31.87 
 
 
184 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000647034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  29.63 
 
 
188 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  31.22 
 
 
188 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  31.65 
 
 
186 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  29.63 
 
 
188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  33.15 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  32.91 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  28.57 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  33.88 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  35.2 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  35 
 
 
189 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  33.88 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  37.18 
 
 
197 aa  98.2  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  37.82 
 
 
186 aa  98.2  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  34.76 
 
 
189 aa  97.8  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  31.69 
 
 
193 aa  97.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  34.91 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  32.42 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  30.07 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  32.91 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  34.44 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  31.52 
 
 
189 aa  96.3  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  33.33 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  40.8 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  29.12 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  31.55 
 
 
188 aa  95.1  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  30.27 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  29.19 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  31.84 
 
 
192 aa  95.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  33.51 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  32.8 
 
 
192 aa  94.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  36.02 
 
 
185 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  32.94 
 
 
175 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  31.01 
 
 
191 aa  94.4  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  31.38 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  28.26 
 
 
180 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  35.06 
 
 
188 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  38.89 
 
 
193 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  28.26 
 
 
180 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  32.94 
 
 
175 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  33.87 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  34.84 
 
 
187 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  32.62 
 
 
190 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  31.38 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  32.94 
 
 
175 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  32.69 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  35.39 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  33.12 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  31.75 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  35.95 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>