More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1702 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  100 
 
 		 184 aa  361  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  84.07 
 
 		 184 aa  303  7e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  86.81 
 
 		 184 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  81.87 
 
 		 187 aa  298  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  80.22 
 
 		 185 aa  297  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  83.52 
 
 		 188 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  76.92 
 
 		 188 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  70.17 
 
 		 183 aa  251  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  66.48 
 
 		 185 aa  238  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  67.03 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  62.09 
 
 		 185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  56.91 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  60.75 
 
 		 189 aa  211  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  58.79 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  55.25 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  57.46 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  56.25 
 
 		 187 aa  197  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  55.11 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  55.11 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  53.85 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  57.14 
 
 		 184 aa  187  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  50 
 
 		 190 aa  185  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  53.85 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  52.41 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  52.38 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  56.59 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  56.59 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  52.94 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  50.27 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  50.79 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  50.26 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  48.3 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  48.15 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  46.24 
 
 		 186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  51.58 
 
 		 185 aa  157  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  48.15 
 
 		 192 aa  154  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  48.21 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  40.43 
 
 		 188 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  43.48 
 
 		 207 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  43.09 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  42.02 
 
 		 207 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  43.52 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  46.49 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  42.46 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  42.93 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  43.64 
 
 		 183 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  41.94 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  46.15 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  41.3 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  39.49 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  42.47 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  40.84 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  42.47 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  42.16 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  41.15 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  43.78 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  40 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  41.24 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  41.24 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.57 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  41.4 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  39.56 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  43.23 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  43.23 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  44.74 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  39.34 
 
 		 209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  37.79 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  43.02 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  38.59 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  41.49 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  39.34 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  39.89 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  39.16 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  43.33 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.45 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  40 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  33.33 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  40.72 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  37.57 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.86 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  38.04 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  40 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  39.41 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  33.51 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  41.94 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  38.62 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  45.45 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  34.92 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  37.18 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  33.15 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.16 
 
 		 220 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.16 
 
 		 220 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  38.92 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.16 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  31.89 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  35.26 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  35.68 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  35.68 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>