More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10608 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  100 
 
 
178 aa  371  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  58.19 
 
 
182 aa  227  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  53.93 
 
 
202 aa  211  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  51.69 
 
 
179 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  35.75 
 
 
178 aa  136  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6231  hypothetical protein  38.98 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  39.44 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  34.64 
 
 
183 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  35.96 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  35.2 
 
 
178 aa  124  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  31.28 
 
 
184 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  35.2 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  33.15 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  36.22 
 
 
187 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  34.05 
 
 
192 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  36.32 
 
 
207 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  35.56 
 
 
184 aa  105  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  28.49 
 
 
187 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  29.28 
 
 
187 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  33.89 
 
 
192 aa  102  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  31.11 
 
 
185 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  28.49 
 
 
198 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  30.17 
 
 
185 aa  98.2  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  30 
 
 
189 aa  97.4  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  32.72 
 
 
189 aa  97.4  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0201  putative methyltransferase  31.89 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  32.24 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  32.79 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  32.09 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  31.35 
 
 
193 aa  95.5  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  32.09 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  34.39 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  39.16 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  32.43 
 
 
205 aa  95.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  29.95 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  28.8 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  31.91 
 
 
188 aa  94.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  31.01 
 
 
193 aa  94.4  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  28.42 
 
 
189 aa  94  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  33.54 
 
 
198 aa  94  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0182  hypothetical protein  38.27 
 
 
157 aa  94  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  36.36 
 
 
182 aa  94  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  31.58 
 
 
186 aa  94  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  30.43 
 
 
184 aa  94  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  29.84 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  31.87 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  33.16 
 
 
191 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  31.32 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  31.41 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  34.55 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  34.1 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  31.87 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  34.1 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  34.59 
 
 
186 aa  92  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  30.93 
 
 
191 aa  92  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  28.33 
 
 
186 aa  92  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  33.33 
 
 
182 aa  91.3  6e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  32.39 
 
 
187 aa  91.3  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  30.48 
 
 
187 aa  90.9  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  33.16 
 
 
189 aa  90.9  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  29.26 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  29.73 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  31.72 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  27.62 
 
 
193 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  28.49 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  34.64 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  31.35 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  31.15 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  32.64 
 
 
207 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  31.49 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  32.78 
 
 
177 aa  89  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  33.11 
 
 
182 aa  88.6  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  32.6 
 
 
178 aa  88.6  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  31.69 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  31.49 
 
 
184 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  29.35 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  32.03 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  32.61 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  30.69 
 
 
194 aa  88.2  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  31.61 
 
 
186 aa  87.8  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  33.54 
 
 
180 aa  87.8  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  28.89 
 
 
188 aa  87.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  31.68 
 
 
186 aa  87  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  33.71 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  28.96 
 
 
202 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  30.81 
 
 
185 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  30.06 
 
 
189 aa  87  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  31.22 
 
 
188 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  30.72 
 
 
192 aa  87  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  87  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  87  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  31.35 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  31.18 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  32.79 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  30.05 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  29.19 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>