More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4517 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  411  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  53.93 
 
 
178 aa  211  7.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  53.3 
 
 
182 aa  201  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  47.19 
 
 
179 aa  168  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6231  hypothetical protein  40.11 
 
 
183 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  43.48 
 
 
179 aa  138  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  32.96 
 
 
178 aa  121  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  34.27 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  35.2 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  32.4 
 
 
178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  31.11 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  30.73 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  36.76 
 
 
186 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  30.69 
 
 
189 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  29.61 
 
 
183 aa  101  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  29.79 
 
 
187 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  36.26 
 
 
184 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  29.79 
 
 
187 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  30.81 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  28.72 
 
 
187 aa  99  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  31.38 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  30.81 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  33.68 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  33.16 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  31.72 
 
 
187 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  31.61 
 
 
193 aa  95.9  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  32.12 
 
 
191 aa  95.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  32 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  35.33 
 
 
183 aa  94.7  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  38.85 
 
 
182 aa  94  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  30.85 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  31.61 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  37.27 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  33.51 
 
 
183 aa  92.4  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  32.46 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  39.84 
 
 
183 aa  91.7  6e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  31.15 
 
 
180 aa  91.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  31.02 
 
 
182 aa  91.7  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  28.29 
 
 
185 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  34.41 
 
 
179 aa  91.7  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  28.33 
 
 
182 aa  91.3  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  33.16 
 
 
194 aa  91.3  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  30.92 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  30.92 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  31.82 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  36.18 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  29.94 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  26.63 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  35.43 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  33.91 
 
 
182 aa  89.7  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  35.43 
 
 
193 aa  89  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  28.93 
 
 
198 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  26.88 
 
 
187 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  30.11 
 
 
187 aa  89  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  29.41 
 
 
188 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  32.04 
 
 
180 aa  88.2  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  29.14 
 
 
189 aa  88.2  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  35.2 
 
 
187 aa  87.8  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0201  putative methyltransferase  35.58 
 
 
198 aa  87  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  35.1 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  31.75 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  30 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  29.87 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  31.18 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  32.81 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  32.5 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  32.03 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  28.65 
 
 
211 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  34.29 
 
 
173 aa  85.9  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  28.66 
 
 
187 aa  85.5  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  29.12 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  28.95 
 
 
185 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  27.43 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  32.07 
 
 
188 aa  84.7  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  32.81 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  26.83 
 
 
187 aa  84.7  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  36.42 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  31.82 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  27.18 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  30.82 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  28.96 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  30.27 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  28.72 
 
 
185 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  28.72 
 
 
185 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  31.82 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  31.82 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  29.03 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  29.03 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  31.87 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  32.47 
 
 
186 aa  82  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  29.89 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0189  methyltransferase, putative  28.11 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0820199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  27.66 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  27.39 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  30.48 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  31.37 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1947  hypothetical protein  27.65 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  32.84 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  30.57 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_177  methyltransferase  28.8 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000132935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>