More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3606 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  70.81 
 
 		 185 aa  255  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  56.15 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  55.74 
 
 		 189 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  58.15 
 
 		 193 aa  195  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  53.48 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  54.64 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  57.07 
 
 		 193 aa  190  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  54.1 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  53.85 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  52.2 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  50.54 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  48.89 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  50.83 
 
 		 188 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  47.34 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  48.63 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  47.25 
 
 		 190 aa  141  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  46.59 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  46.96 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  43.04 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  43.55 
 
 		 189 aa  137  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  44.75 
 
 		 191 aa  134  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  44.2 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  40.86 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  47.16 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  44.38 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  44.38 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  44.44 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  42.08 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  40.64 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  43.75 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  41.14 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  43.08 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  42.19 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  40.66 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  45.74 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  41.94 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  36.61 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  40.98 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  37.78 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  40.68 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  40.11 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  43.82 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  38.62 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  40.68 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  40 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  37.77 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  39.01 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 202 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  39.34 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  37.57 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  38.07 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  38.07 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  35.16 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  40.23 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  34.24 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  35.56 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  40.11 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  35.56 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  35.56 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  41.14 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  36.11 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  38.64 
 
 		 183 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  36.81 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  36.11 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  39.35 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  36.11 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  41.14 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  33.7 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  36.11 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.5 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  36.02 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  35.98 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  38.92 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.61 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  47.54 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  31.11 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  37.36 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  32.76 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  38.8 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  35.56 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  37.7 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  38.73 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.14 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  39.56 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  37.42 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  40.76 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  35.52 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  38.5 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  39.38 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  38.8 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  38.25 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.7 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  39.74 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.96 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.96 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.81 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  34.29 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  43.06 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>