More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0643 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  100 
 
 
189 aa  374  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  60.75 
 
 
184 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  57.98 
 
 
185 aa  207  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  58.82 
 
 
185 aa  205  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  60.96 
 
 
185 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  56.45 
 
 
187 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  56.84 
 
 
183 aa  195  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  55.91 
 
 
184 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  58.38 
 
 
186 aa  191  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  55.03 
 
 
185 aa  190  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  51.34 
 
 
186 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  56.68 
 
 
186 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  55.61 
 
 
187 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  55.03 
 
 
188 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  57.53 
 
 
184 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  57.22 
 
 
188 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  55.85 
 
 
187 aa  184  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  55.32 
 
 
187 aa  184  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  55.32 
 
 
187 aa  184  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  52.15 
 
 
186 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  48.11 
 
 
186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  55.03 
 
 
184 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  52.11 
 
 
186 aa  168  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  50.26 
 
 
191 aa  168  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  50.26 
 
 
185 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  54.45 
 
 
184 aa  164  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  54.45 
 
 
184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  50 
 
 
198 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  48.94 
 
 
185 aa  157  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  43.55 
 
 
190 aa  154  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  48.95 
 
 
184 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  48.42 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  46.32 
 
 
184 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  47.12 
 
 
185 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  44.74 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  47.37 
 
 
185 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  46.88 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  44.74 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  41.33 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  47.5 
 
 
197 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  42.19 
 
 
193 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  43.16 
 
 
193 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  41.15 
 
 
194 aa  121  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  38.95 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  41.67 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  39.89 
 
 
187 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  39.1 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  40 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  37.57 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  42.78 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  42.78 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  45.3 
 
 
185 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  43.55 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  42.29 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  38.71 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  37.63 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  37.5 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  41.4 
 
 
193 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  43.26 
 
 
182 aa  111  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  43.98 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  36.84 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  41.45 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  44.81 
 
 
184 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  41.71 
 
 
188 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  41.94 
 
 
186 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  40.88 
 
 
192 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  47.83 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  43.9 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  39.78 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  39.58 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  41.4 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  42.75 
 
 
184 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  43.24 
 
 
188 aa  108  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  40.86 
 
 
173 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  32.11 
 
 
185 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  40.86 
 
 
202 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  37.08 
 
 
205 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  37.57 
 
 
186 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  40.99 
 
 
186 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  40.5 
 
 
202 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  39.15 
 
 
189 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  45.57 
 
 
196 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  44.32 
 
 
180 aa  104  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  41.36 
 
 
187 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  36.46 
 
 
187 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  40.91 
 
 
209 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  38.35 
 
 
187 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.6 
 
 
191 aa  101  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  38.8 
 
 
189 aa  101  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.39 
 
 
220 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.39 
 
 
220 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  32.26 
 
 
180 aa  101  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  32.26 
 
 
180 aa  101  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  40.61 
 
 
174 aa  100  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  40.22 
 
 
187 aa  100  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.39 
 
 
220 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.62 
 
 
207 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  39.56 
 
 
185 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  32.42 
 
 
184 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.6 
 
 
191 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>