More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18420 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  100 
 
 
184 aa  357  5e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  50 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  50 
 
 
187 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  45.36 
 
 
191 aa  143  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  50 
 
 
203 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  46.45 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  45.11 
 
 
189 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  45.65 
 
 
193 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  44.92 
 
 
192 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  49.45 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  46.2 
 
 
186 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  45.41 
 
 
184 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  45.6 
 
 
187 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  50.81 
 
 
198 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  44.56 
 
 
193 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  42.08 
 
 
185 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  44.39 
 
 
204 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  42.39 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  48.9 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  46.67 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  46.67 
 
 
175 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  46.67 
 
 
175 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  47.31 
 
 
192 aa  124  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  45.7 
 
 
185 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  40.7 
 
 
194 aa  121  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  42.7 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  43.29 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  46.11 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  44.5 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  39.56 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  41.21 
 
 
188 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  41.98 
 
 
187 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  43.17 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  42.54 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  42.7 
 
 
185 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  44.51 
 
 
184 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  41.76 
 
 
187 aa  108  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  42.11 
 
 
187 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  38.67 
 
 
182 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  35.56 
 
 
178 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  43.89 
 
 
186 aa  104  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  41.4 
 
 
189 aa  104  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  39.34 
 
 
187 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  40.88 
 
 
192 aa  104  8e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  43.09 
 
 
184 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  44.51 
 
 
205 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  41.08 
 
 
191 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  41.88 
 
 
197 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  39.02 
 
 
174 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  42.47 
 
 
185 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  39.67 
 
 
190 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  38.25 
 
 
189 aa  101  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  35.87 
 
 
188 aa  100  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  42.31 
 
 
183 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  37.63 
 
 
184 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  40.93 
 
 
185 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  37.84 
 
 
186 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  40.86 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  35.29 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  40.76 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  48.39 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  42.52 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  34.97 
 
 
207 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  39.39 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  35.39 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  39.56 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  35.2 
 
 
200 aa  95.9  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  48.39 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  31.32 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  38.2 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  36.81 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  36.81 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  36.65 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  39.23 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  38.67 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  38.67 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  47.58 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  37.91 
 
 
184 aa  94.7  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  36.67 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  37.71 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  36.41 
 
 
187 aa  94  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0056  methyltransferase  35.68 
 
 
215 aa  94  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1515  methyltransferase  44.3 
 
 
177 aa  94  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.82046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.51 
 
 
191 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.51 
 
 
191 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  37.1 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  35.06 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  33.55 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  43.51 
 
 
197 aa  92.4  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  36.22 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.52 
 
 
199 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  35.9 
 
 
198 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  38.8 
 
 
187 aa  92  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  44.35 
 
 
190 aa  92  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  33.9 
 
 
199 aa  92  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  41.88 
 
 
190 aa  92  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  36.29 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  35.36 
 
 
191 aa  92  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  31.67 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  37.93 
 
 
192 aa  92  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>