More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0653 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  50.53 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  49.47 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  48.15 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  45.26 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  45.21 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  45.74 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  51.31 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  47.06 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  50.26 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  43.33 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  43.33 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  48.96 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  43.48 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  45.92 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  45.26 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  41.8 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  44.74 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  45.26 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  45.31 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  45.79 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  44.74 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  48.44 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  43.62 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  46.81 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  46.81 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  47.37 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  43.55 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  46.81 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  42.86 
 
 		 186 aa  130  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  44.21 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  42.49 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  46.6 
 
 		 184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  44.21 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  42.02 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  38.46 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  38.3 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  44.79 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  43.62 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  41.41 
 
 		 191 aa  118  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  41.8 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  38.8 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  37.89 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  38.14 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  38.62 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  41.05 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.56 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  35.23 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  35.23 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.06 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  37.63 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  37.89 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  43.21 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  35.05 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.56 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  40.82 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  36.36 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  40.1 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  36.65 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  37.31 
 
 		 192 aa  107  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  29.47 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  40.46 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  38.79 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  40.38 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  32.63 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  40.43 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.84 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  41.99 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  40.91 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  43.83 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  39.29 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  39.68 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  36.7 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  36.04 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  36.04 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  42.05 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  33.15 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.99 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.78 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.99 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  34.44 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.99 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  31.25 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  41.99 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  35.26 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.31 
 
 		 199 aa  99  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  39.47 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  39.38 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  34.18 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  34.95 
 
 		 187 aa  98.6  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  39.62 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  34.2 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  28.88 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  37.77 
 
 		 200 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  32.91 
 
 		 188 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  32.91 
 
 		 188 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  35.05 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.75 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.11 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  31.91 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>