More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2378 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  53.8 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  54.1 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  54.44 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  50.27 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  54.95 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  49.19 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  50 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  49.45 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  48.09 
 
 		 187 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  49.17 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  48.9 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  48.88 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  47.31 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  46.74 
 
 		 186 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  51.63 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  51.63 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  49.73 
 
 		 184 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  47.73 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  47.73 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  47.73 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  46.74 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  46.99 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  45.11 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  43.78 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  43.55 
 
 		 189 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  44.68 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  41.85 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  44.26 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  40.96 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  45.65 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  42.63 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  41.8 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  43.65 
 
 		 184 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  43.15 
 
 		 207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  38.92 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  42.86 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  42.31 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  37.84 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  40.11 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  37.84 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  39.46 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  37.3 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  38.17 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.84 
 
 		 194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  38.83 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  40.11 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  39.57 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  42.08 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  38.62 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  38.89 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  40.22 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  37.37 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  41.08 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  39.36 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  37.57 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  36.52 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  37.44 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  37.43 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  42.47 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  37.43 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  37.43 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  37.1 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  37.43 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  36.41 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  39.46 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  35.14 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  39.89 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.37 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.76 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  36.65 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.46 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  37.3 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  38.5 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  36.27 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.76 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.3 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  36.46 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.46 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.46 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.46 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  40 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  40.54 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  38.5 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  38.5 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  38.5 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.13 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  35.16 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  40.38 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  35.94 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  35.23 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  35.94 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  35.42 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.94 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  37.16 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  37.3 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  39.15 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  35.64 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  32.62 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>