More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1244 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  100 
 
 
187 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  64.32 
 
 
188 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  57.92 
 
 
207 aa  214  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  51.37 
 
 
193 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  49.73 
 
 
189 aa  175  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  51.37 
 
 
193 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  50.82 
 
 
189 aa  158  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  46.99 
 
 
187 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  41.62 
 
 
186 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  40.22 
 
 
210 aa  147  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  43.48 
 
 
194 aa  147  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  41.3 
 
 
184 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  43.92 
 
 
186 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  42.78 
 
 
178 aa  141  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  42.47 
 
 
180 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  47.09 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  41.62 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  45.55 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  37.84 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  45.11 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  45.11 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  46.88 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  44.21 
 
 
186 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  42.63 
 
 
186 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  46.52 
 
 
185 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  44.39 
 
 
187 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  46.52 
 
 
184 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  43.85 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  40.98 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  35.48 
 
 
183 aa  132  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  46.52 
 
 
184 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  41.85 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  44.09 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  43.09 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  38.5 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  41.18 
 
 
184 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  40.11 
 
 
207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  34.78 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  44.92 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  36.41 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  34.78 
 
 
185 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  43.32 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  30.98 
 
 
186 aa  124  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  41.4 
 
 
186 aa  124  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  41.67 
 
 
185 aa  123  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  31.72 
 
 
183 aa  123  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  42.39 
 
 
191 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  37.5 
 
 
188 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  42.78 
 
 
188 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  43.32 
 
 
185 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  36.96 
 
 
188 aa  121  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  38.04 
 
 
184 aa  121  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  40.11 
 
 
190 aa  121  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  37.78 
 
 
180 aa  121  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  38.17 
 
 
187 aa  121  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  36.96 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  36.96 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  36.96 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  36.96 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  44.16 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  45.28 
 
 
180 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  41 
 
 
197 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  39.36 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  40.53 
 
 
185 aa  117  7e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  37.78 
 
 
180 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  37.78 
 
 
180 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  43.85 
 
 
185 aa  117  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  36.41 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  41.85 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  36.41 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  36.41 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  36.41 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  36.41 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  41.85 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  38.92 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  36.36 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  40.64 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  38.74 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  42.7 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  36.56 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  39.38 
 
 
186 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  38.38 
 
 
179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  34.05 
 
 
198 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  40.96 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  37.63 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  37.84 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  39.46 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  33.15 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  33.7 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  38.76 
 
 
208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0164  putative methyltransferase  30.27 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0357568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  40.49 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  38.17 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  40.22 
 
 
187 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_177  methyltransferase  30.81 
 
 
192 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000132935  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  41.21 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  36.9 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  34.05 
 
 
198 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  32.26 
 
 
183 aa  111  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  37.89 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>