More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3093 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  100 
 
 
183 aa  362  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  70.17 
 
 
184 aa  251  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  68.51 
 
 
184 aa  242  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  66.85 
 
 
185 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  67.76 
 
 
187 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  69.44 
 
 
185 aa  238  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  68.31 
 
 
185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  67.39 
 
 
184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  66.85 
 
 
188 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  62.3 
 
 
188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  60 
 
 
186 aa  214  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  60.87 
 
 
185 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  65.36 
 
 
187 aa  208  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  65.36 
 
 
187 aa  208  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  65.36 
 
 
187 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  56.76 
 
 
191 aa  200  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  57.38 
 
 
186 aa  200  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  56.84 
 
 
189 aa  195  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  54.7 
 
 
186 aa  195  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  54.44 
 
 
190 aa  193  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  52.49 
 
 
186 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  54.84 
 
 
198 aa  178  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  51.93 
 
 
186 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  58.33 
 
 
184 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  52.94 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  49.73 
 
 
186 aa  171  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  48.31 
 
 
185 aa  170  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  57.22 
 
 
184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  57.22 
 
 
184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  49.73 
 
 
185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  50 
 
 
185 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  48.39 
 
 
184 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  48.39 
 
 
184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  46.77 
 
 
184 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  50.26 
 
 
185 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  47.06 
 
 
192 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  47.27 
 
 
183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  50.97 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  44.51 
 
 
193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  40.64 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  48.35 
 
 
185 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  45.45 
 
 
184 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  37.97 
 
 
186 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  38.5 
 
 
188 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  44.32 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  45.1 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  44.57 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  41.21 
 
 
185 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  44.51 
 
 
203 aa  118  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  43.72 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  45.95 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  39.34 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  43.01 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  42.02 
 
 
193 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  46.2 
 
 
187 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  47.56 
 
 
186 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  40.64 
 
 
193 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  39.46 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  40.11 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  43.96 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  42.24 
 
 
196 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  39.38 
 
 
194 aa  112  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  41.53 
 
 
202 aa  111  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  39.36 
 
 
207 aa  111  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  36.61 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  38.82 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.76 
 
 
220 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.76 
 
 
220 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  42.93 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  40.53 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.76 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  45.66 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  39.13 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  33.16 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  42.33 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  35.53 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  42.08 
 
 
193 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  44.16 
 
 
189 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.59 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.08 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  44.44 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  33.51 
 
 
194 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  41.49 
 
 
192 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  42.39 
 
 
188 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.86 
 
 
191 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  47.1 
 
 
187 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.42 
 
 
199 aa  107  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  40.86 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  39.04 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  39.04 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  32.43 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  42.58 
 
 
194 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  40.91 
 
 
184 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  36.42 
 
 
200 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.42 
 
 
207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.42 
 
 
207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.92 
 
 
198 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.92 
 
 
198 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.42 
 
 
207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.42 
 
 
207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>