More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09440 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  100 
 
 		 189 aa  363  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  59.24 
 
 		 188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  53.76 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  56.57 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  56.22 
 
 		 193 aa  168  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  53.04 
 
 		 188 aa  166  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  48.89 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  52.75 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  51.65 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  51.38 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  50 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  51.1 
 
 		 193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  48.9 
 
 		 191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  50 
 
 		 203 aa  154  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  53.89 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  50.55 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  48.65 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  52.27 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  51.4 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  53.12 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  50.62 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  48.15 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  52.97 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  47.25 
 
 		 190 aa  140  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  48.07 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  48.52 
 
 		 175 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  48.52 
 
 		 175 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  50.57 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  50 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  47.93 
 
 		 175 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  46.45 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  44.68 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  44.27 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  50.54 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  46.11 
 
 		 184 aa  117  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  42.64 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  45.95 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  43.78 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  41.57 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  43.02 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  44.44 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  41.99 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  43.82 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  43.82 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  34.95 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0164  putative methyltransferase  37.71 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0357568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  43.02 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  45.39 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  41.44 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  38.42 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_177  methyltransferase  38.2 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000132935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  37.78 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  42.7 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0189  methyltransferase, putative  38.2 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0820199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  43.79 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  42.7 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  42.47 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  45.28 
 
 		 180 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  44.75 
 
 		 185 aa  104  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  47.74 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  41.34 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  40.64 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  40.31 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  42.16 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  41.57 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  41.34 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  43.58 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  38.92 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.11 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  37.43 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.11 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.11 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  40.88 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  38.69 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  41.45 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  42.78 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  44.13 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  44.13 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  39.47 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  35.94 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  34.46 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.82 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  46.71 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  35.36 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  42.41 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  41.08 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  51.2 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  39.78 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  34.78 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  46.43 
 
 		 173 aa  98.2  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  42.86 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  38.67 
 
 		 187 aa  97.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.07 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  42.11 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  50.4 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1260  N6-adenine-specific methylase  36.76 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  35.87 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  38.71 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>