More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0189 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0189  methyltransferase, putative  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0820199  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_177  methyltransferase  94.79 
 
 
192 aa  377  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000132935  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0164  putative methyltransferase  93.75 
 
 
192 aa  373  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0357568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  38.33 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  36.31 
 
 
189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  36.67 
 
 
191 aa  124  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  36.67 
 
 
192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  34.44 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  33.52 
 
 
207 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  34.07 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  35.16 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  35.29 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  33.52 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  32.58 
 
 
188 aa  111  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  34.62 
 
 
189 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  32.02 
 
 
179 aa  110  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  30.81 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  32.61 
 
 
182 aa  108  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  29.73 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  32.42 
 
 
184 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  33.68 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  33.52 
 
 
187 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  31.87 
 
 
193 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  32.42 
 
 
188 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  38.2 
 
 
189 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  32.43 
 
 
210 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  32.42 
 
 
188 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  28.8 
 
 
186 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  32.97 
 
 
184 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  30.34 
 
 
179 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  32.42 
 
 
188 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  32.42 
 
 
188 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  32.42 
 
 
188 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  32.42 
 
 
188 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  36.36 
 
 
185 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  32.42 
 
 
188 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  32.42 
 
 
188 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  28.42 
 
 
183 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  32.42 
 
 
188 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  29.67 
 
 
183 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  40.6 
 
 
192 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  31.32 
 
 
188 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  33.7 
 
 
179 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  37.42 
 
 
193 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  33.7 
 
 
179 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  36.61 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  33.15 
 
 
179 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  29.51 
 
 
187 aa  98.6  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  30.65 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  31.32 
 
 
185 aa  98.6  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  30.77 
 
 
185 aa  97.8  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  27.47 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  32.6 
 
 
189 aa  96.3  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  33.7 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  32.42 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  38.32 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  40.44 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  33.7 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  29.05 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  35.29 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  34.83 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  33.88 
 
 
188 aa  95.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  37.74 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  32.12 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  38.22 
 
 
187 aa  94.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_17059  predicted protein  31.28 
 
 
216 aa  94.4  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  36.87 
 
 
188 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  32.42 
 
 
193 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  35.33 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  33.69 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  32.97 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  33.7 
 
 
190 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  29.89 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  28.88 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  31.96 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  31.96 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3082  methyltransferase  36.59 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  32.47 
 
 
193 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  32.47 
 
 
193 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.33 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.72 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  35.56 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  39.34 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  32.97 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  29.57 
 
 
188 aa  92  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  30.39 
 
 
183 aa  92  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  29.67 
 
 
186 aa  91.7  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  27.96 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  30.98 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  32.24 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  28.26 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  30.98 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  31.03 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  38.93 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  27.96 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  33.83 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  29.74 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  33.07 
 
 
184 aa  89  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  33.97 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  31.41 
 
 
178 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>