More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1563 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  100 
 
 
186 aa  358  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  58.79 
 
 
187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  53.59 
 
 
188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  53.63 
 
 
188 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  56.52 
 
 
198 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  53.65 
 
 
202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  54.71 
 
 
175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  54.71 
 
 
175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  54.71 
 
 
175 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  53.16 
 
 
189 aa  160  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  53.99 
 
 
174 aa  160  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  55.25 
 
 
187 aa  158  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  54.29 
 
 
184 aa  158  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  54.49 
 
 
193 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  53.41 
 
 
185 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  53.3 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  52.51 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  51.93 
 
 
193 aa  151  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  51.96 
 
 
187 aa  151  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  52.15 
 
 
174 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  48.89 
 
 
203 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  50.57 
 
 
189 aa  147  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  47.89 
 
 
189 aa  147  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  50.26 
 
 
186 aa  147  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  49.44 
 
 
191 aa  143  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  53.16 
 
 
185 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  47.16 
 
 
185 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  48.66 
 
 
204 aa  130  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  45.92 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  46.99 
 
 
192 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  49.47 
 
 
187 aa  127  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  52.97 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  46.2 
 
 
190 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  42.31 
 
 
194 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  47.19 
 
 
188 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  47.28 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  37.3 
 
 
183 aa  117  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  45.11 
 
 
185 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  43.02 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  43.62 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  42.37 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  44.21 
 
 
186 aa  114  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  43.65 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  44.26 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  44.23 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  44.23 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  40.76 
 
 
178 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  40.45 
 
 
207 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  41.99 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  43.89 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  43.17 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  43.75 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  42.7 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  43.01 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  43.65 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  43.87 
 
 
187 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  47.4 
 
 
180 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.8 
 
 
202 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  40.66 
 
 
185 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  36.36 
 
 
178 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  42.31 
 
 
188 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  43.02 
 
 
192 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.46 
 
 
191 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  45.41 
 
 
185 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  45.39 
 
 
184 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  41.44 
 
 
188 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  40.22 
 
 
182 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  38.56 
 
 
181 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  42.16 
 
 
200 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  46.31 
 
 
228 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  44.08 
 
 
188 aa  104  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  42.16 
 
 
197 aa  104  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.85 
 
 
191 aa  104  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  44.13 
 
 
183 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  40.23 
 
 
202 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  48 
 
 
203 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  41.62 
 
 
200 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  41.62 
 
 
200 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  40.54 
 
 
200 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  38.38 
 
 
186 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  43.75 
 
 
173 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  41.94 
 
 
189 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.99 
 
 
199 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  43.23 
 
 
185 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  39.66 
 
 
201 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  55.65 
 
 
179 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  39.88 
 
 
199 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  34.64 
 
 
178 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  37.91 
 
 
181 aa  101  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  36.02 
 
 
182 aa  102  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  40.88 
 
 
187 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  55.65 
 
 
179 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  41.9 
 
 
184 aa  101  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  55.65 
 
 
179 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  35.96 
 
 
182 aa  100  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2064  putative methyltransferase  47.57 
 
 
179 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371862  normal  0.712405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  39.57 
 
 
190 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1395  putative methyltransferase  36 
 
 
175 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1441  methyltransferase  36 
 
 
175 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  42.46 
 
 
187 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>