More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1878 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  100 
 
 
189 aa  362  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  50.53 
 
 
193 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  47.59 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  48.69 
 
 
188 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  49.74 
 
 
184 aa  148  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  45.99 
 
 
187 aa  147  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  50.78 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  47.15 
 
 
198 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  49.74 
 
 
188 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  48.15 
 
 
189 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  46.56 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  43.55 
 
 
185 aa  137  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  44.97 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  48.92 
 
 
185 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  43.39 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  43.92 
 
 
189 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  46.99 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  43.01 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  47.87 
 
 
185 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  43.32 
 
 
190 aa  122  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  44.44 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  42.25 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  44.58 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  43.72 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  47.31 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  47.31 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  41.94 
 
 
192 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  40.96 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  41.88 
 
 
197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  46.71 
 
 
175 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  48.1 
 
 
196 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  43.33 
 
 
201 aa  111  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  37.02 
 
 
192 aa  111  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  46.49 
 
 
187 aa  111  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  42.62 
 
 
187 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  47.28 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  40.43 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  40.11 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  41.8 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  40.22 
 
 
188 aa  108  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  43.72 
 
 
187 aa  108  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  43.3 
 
 
202 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.56 
 
 
202 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  36.96 
 
 
207 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  39.57 
 
 
185 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  38.1 
 
 
184 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  41.4 
 
 
184 aa  104  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  47.62 
 
 
173 aa  104  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  44.72 
 
 
192 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  37.16 
 
 
180 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  44.13 
 
 
205 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  41.99 
 
 
187 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  38.38 
 
 
186 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  52.71 
 
 
185 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  39.34 
 
 
187 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  40.88 
 
 
185 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  39.36 
 
 
188 aa  100  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  36.81 
 
 
178 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  38.95 
 
 
187 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  41.49 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  38.92 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  38.83 
 
 
193 aa  99  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  39.15 
 
 
184 aa  99  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  49.22 
 
 
180 aa  99  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  47.53 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  34.62 
 
 
185 aa  98.6  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.35 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  31.91 
 
 
210 aa  97.8  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1433  putative methyltransferase  34.54 
 
 
195 aa  97.8  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  35.68 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  40.64 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  36.61 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  39.02 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.75 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  35.26 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  39.04 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.8 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  40.64 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  37.43 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  38.25 
 
 
187 aa  95.5  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  38.25 
 
 
187 aa  95.5  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  40 
 
 
183 aa  95.5  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  32.26 
 
 
186 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  36.76 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  31.89 
 
 
187 aa  95.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  40.11 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.26 
 
 
206 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  28.42 
 
 
178 aa  94  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  39.47 
 
 
192 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  40.64 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  45.45 
 
 
228 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  39.78 
 
 
191 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  34.95 
 
 
185 aa  94  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  44.36 
 
 
180 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  40.64 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  37.8 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  38.41 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  37.3 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.8 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  47.73 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>