More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0647 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  377  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  66.32 
 
 
189 aa  240  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  67.21 
 
 
193 aa  235  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  65.05 
 
 
186 aa  224  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  62.03 
 
 
189 aa  218  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  59.68 
 
 
187 aa  207  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  59.68 
 
 
187 aa  203  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  56.77 
 
 
198 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  55.32 
 
 
202 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  57.07 
 
 
185 aa  190  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  57.3 
 
 
185 aa  175  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  55.38 
 
 
188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  55.25 
 
 
188 aa  170  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  52.13 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  52.85 
 
 
187 aa  164  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  54.26 
 
 
185 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  52.15 
 
 
184 aa  158  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  51.1 
 
 
189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  53.37 
 
 
174 aa  154  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  51.89 
 
 
203 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  51.53 
 
 
174 aa  148  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  45.5 
 
 
204 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  53.89 
 
 
175 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  53.89 
 
 
175 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  53.89 
 
 
175 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  44.97 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  46.56 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  47.57 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  51.93 
 
 
186 aa  137  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  45.65 
 
 
184 aa  136  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  46.99 
 
 
191 aa  135  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  48.6 
 
 
187 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  44.39 
 
 
190 aa  131  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  42.47 
 
 
188 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  50.52 
 
 
192 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  38.5 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  43.15 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  42.7 
 
 
185 aa  124  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  43.41 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  42.08 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  46.24 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  38.8 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  41.85 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  40.44 
 
 
184 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  39.44 
 
 
185 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  41.27 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  39.46 
 
 
193 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  43.72 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  39.56 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  38.46 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  39.89 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  39.44 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  38.66 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  45.9 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  41.4 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  41.4 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  44.58 
 
 
196 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  41.53 
 
 
187 aa  112  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  47.17 
 
 
180 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  41.4 
 
 
189 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  42.22 
 
 
205 aa  111  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  41.62 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  40 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  38.33 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  38.92 
 
 
193 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  53.03 
 
 
179 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  38.76 
 
 
188 aa  108  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  42.08 
 
 
183 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  53.03 
 
 
179 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  42.41 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  53.03 
 
 
179 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  38.19 
 
 
194 aa  108  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.33 
 
 
191 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  43.39 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  50.41 
 
 
173 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  39.42 
 
 
192 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.76 
 
 
191 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  37.56 
 
 
187 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  37.77 
 
 
184 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  43.95 
 
 
180 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  38.67 
 
 
180 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  44.57 
 
 
185 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  44.05 
 
 
191 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  45.91 
 
 
197 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  39.69 
 
 
197 aa  105  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  40.11 
 
 
186 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 
202 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  35.39 
 
 
199 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  42.41 
 
 
184 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  41.62 
 
 
185 aa  104  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  41.08 
 
 
189 aa  104  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  37.91 
 
 
188 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2064  putative methyltransferase  48.63 
 
 
179 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371862  normal  0.712405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  39.44 
 
 
187 aa  104  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  39.44 
 
 
187 aa  104  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  42.95 
 
 
188 aa  104  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  42.31 
 
 
186 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.08 
 
 
198 aa  104  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  42.41 
 
 
184 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>