More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1371 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  100 
 
 
185 aa  348  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  57.75 
 
 
193 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  55.32 
 
 
189 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  54.26 
 
 
193 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  55.68 
 
 
188 aa  165  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  55.08 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  54.74 
 
 
198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  55.32 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  55.08 
 
 
189 aa  161  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  56.28 
 
 
203 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  56.68 
 
 
184 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  53.55 
 
 
185 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  51.91 
 
 
188 aa  158  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  48.63 
 
 
185 aa  158  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  50.83 
 
 
191 aa  155  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  53.4 
 
 
202 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  56.15 
 
 
192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  51.34 
 
 
186 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  49.73 
 
 
204 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  49.73 
 
 
192 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  52.97 
 
 
189 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  53.76 
 
 
187 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  51.1 
 
 
184 aa  147  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  49.23 
 
 
202 aa  145  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  53.16 
 
 
186 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  48.13 
 
 
189 aa  134  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  49.45 
 
 
184 aa  135  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  52.43 
 
 
187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  52.22 
 
 
180 aa  127  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  45.7 
 
 
190 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  50 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  49.19 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  43.17 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  45 
 
 
192 aa  117  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  40.21 
 
 
194 aa  115  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  43.62 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2064  putative methyltransferase  49.72 
 
 
179 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371862  normal  0.712405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  41.4 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  54.55 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  46.3 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  54.55 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  43.89 
 
 
183 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  53.79 
 
 
179 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  43.55 
 
 
185 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  42.54 
 
 
185 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  42.54 
 
 
185 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  42.47 
 
 
184 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  42.47 
 
 
184 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  42.47 
 
 
184 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  34.43 
 
 
184 aa  106  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.16 
 
 
194 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  47.31 
 
 
175 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  47.31 
 
 
175 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  43.52 
 
 
191 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  47.31 
 
 
175 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  39.46 
 
 
193 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  43.24 
 
 
205 aa  104  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  36.17 
 
 
184 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1260  N6-adenine-specific methylase  38.92 
 
 
186 aa  104  9e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  42.02 
 
 
196 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  44.26 
 
 
177 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  41.03 
 
 
191 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  40.43 
 
 
191 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  40.11 
 
 
189 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  45.51 
 
 
174 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  31.84 
 
 
186 aa  101  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  36.84 
 
 
198 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  35.14 
 
 
182 aa  100  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  38.55 
 
 
205 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  35.56 
 
 
180 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  35.71 
 
 
183 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  33.69 
 
 
187 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  41.71 
 
 
184 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  31.72 
 
 
188 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  31.72 
 
 
188 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  31.72 
 
 
188 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  32.97 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  31.72 
 
 
188 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  37.16 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  31.72 
 
 
188 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  41.88 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  42.78 
 
 
173 aa  98.2  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  42.41 
 
 
192 aa  97.8  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  36.56 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  41.27 
 
 
185 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  31.58 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  29.73 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  31.05 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  30.53 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  38.83 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  38.22 
 
 
201 aa  96.3  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  40.11 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  39.68 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  41.44 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  40.57 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  40.11 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  32.24 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  30.53 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  40.84 
 
 
185 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  31.67 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>