More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4642 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  100 
 
 
187 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  55.98 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  56.45 
 
 
189 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  52.41 
 
 
184 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  48.09 
 
 
186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  54.59 
 
 
185 aa  177  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  50.81 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  51.35 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  52.94 
 
 
183 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  52.84 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  48.66 
 
 
186 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  51.7 
 
 
185 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  50 
 
 
184 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  53.51 
 
 
185 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  48.65 
 
 
186 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  49.46 
 
 
184 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  50.85 
 
 
185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  46.41 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  49.74 
 
 
197 aa  160  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  45.3 
 
 
187 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  45.3 
 
 
187 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  43.78 
 
 
190 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  49.21 
 
 
198 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  47.83 
 
 
191 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  49.19 
 
 
188 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  48.17 
 
 
184 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  47.85 
 
 
186 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  46.6 
 
 
185 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  49.74 
 
 
184 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  49.21 
 
 
184 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  47.57 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  44.68 
 
 
185 aa  145  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  42.78 
 
 
185 aa  143  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  45.26 
 
 
185 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  47.57 
 
 
184 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  47.57 
 
 
184 aa  137  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  47.57 
 
 
184 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  45.79 
 
 
192 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  44.92 
 
 
193 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  44.15 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  46.77 
 
 
202 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  43.55 
 
 
198 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  41.94 
 
 
173 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  42.19 
 
 
185 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  37.1 
 
 
188 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.97 
 
 
194 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  42.11 
 
 
192 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  41.62 
 
 
180 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  38.17 
 
 
187 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  38.38 
 
 
180 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  47.03 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  45.62 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  43.22 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  42.33 
 
 
191 aa  118  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  39.25 
 
 
183 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  42.71 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  41.36 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  46.03 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  43.92 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  42.33 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  38.95 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  35.14 
 
 
207 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  30.11 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  41.27 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  45.59 
 
 
189 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  41.01 
 
 
189 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  40.74 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  43.78 
 
 
189 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  36.02 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  33.87 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  40.32 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  40.32 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  43.68 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  30.32 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  32.8 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  44.21 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  43.09 
 
 
187 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  32.8 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  32.8 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  34.59 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  41.53 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  32.8 
 
 
188 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  33.33 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  32.8 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  32.8 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  32.8 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  32.8 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  32.8 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  34.57 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  43.39 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  37.5 
 
 
201 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  31.18 
 
 
183 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.94 
 
 
191 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  37.3 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  38.2 
 
 
187 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  34.41 
 
 
198 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.35 
 
 
199 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  42.86 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  36.65 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>