More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1673 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  100 
 
 
191 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  61.88 
 
 
203 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  56.22 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  53.89 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  51.87 
 
 
192 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  50 
 
 
188 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  48.9 
 
 
189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  49.2 
 
 
193 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  45.5 
 
 
192 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  44.74 
 
 
204 aa  144  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  47.34 
 
 
198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  45.36 
 
 
184 aa  143  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  50.83 
 
 
185 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  46.15 
 
 
189 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  46.99 
 
 
193 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  38.95 
 
 
194 aa  135  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  47.59 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  44.75 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  42.31 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  47.59 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  46.45 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  46.56 
 
 
202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  49.44 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  44.44 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  46.33 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  42.86 
 
 
186 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  47.03 
 
 
185 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  45.23 
 
 
202 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  42.86 
 
 
189 aa  121  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  42.16 
 
 
190 aa  121  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  43.32 
 
 
187 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  41.8 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  43.35 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  43.35 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  40.86 
 
 
183 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  40.51 
 
 
174 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1086  N6-adenine-specific methylase  40.27 
 
 
164 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  44.25 
 
 
175 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  37.36 
 
 
190 aa  104  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  39.24 
 
 
174 aa  104  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 
202 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  39.89 
 
 
187 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  35.03 
 
 
178 aa  98.6  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  40.74 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  36.76 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  37.5 
 
 
182 aa  98.2  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  40.34 
 
 
196 aa  97.8  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  36.76 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  37.84 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  37.84 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  39.46 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  34.24 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  45.9 
 
 
191 aa  94  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  43.01 
 
 
180 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  36.76 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  34.07 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  36.56 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  35.91 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  36.87 
 
 
184 aa  92  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  34.97 
 
 
207 aa  92  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  36.87 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  48.36 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  45.97 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.43 
 
 
199 aa  91.3  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  34.27 
 
 
211 aa  91.3  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  31.77 
 
 
186 aa  91.3  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.11 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  30.6 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09101  N6-adenine-specific methylase  35.75 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.683798 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  35.14 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  45.6 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  39.02 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  34.25 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  42.97 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  45.24 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  31.05 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  35.71 
 
 
192 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  37.5 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  36.87 
 
 
184 aa  89  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  31.25 
 
 
203 aa  89  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  31.28 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  40.8 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  44.8 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  46.51 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  32.63 
 
 
193 aa  88.2  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  45.74 
 
 
189 aa  87.8  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  32.07 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  32.63 
 
 
193 aa  88.2  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  34.2 
 
 
193 aa  87.8  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  31.52 
 
 
185 aa  87.8  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1260  N6-adenine-specific methylase  36.67 
 
 
186 aa  87.8  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  44.72 
 
 
183 aa  87  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.78 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  34.02 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  38.17 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  38.04 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  32.98 
 
 
185 aa  87  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  37.77 
 
 
205 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.21 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  35.68 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>