More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6590 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  100 
 
 
185 aa  355  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  90.76 
 
 
185 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  75.96 
 
 
185 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  68.68 
 
 
184 aa  241  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  69.44 
 
 
183 aa  238  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  66.48 
 
 
184 aa  238  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  64.44 
 
 
185 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  67.03 
 
 
184 aa  231  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  62.3 
 
 
188 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  64.48 
 
 
187 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  65.03 
 
 
188 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  61.75 
 
 
191 aa  217  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  68.11 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  58.89 
 
 
186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  53.8 
 
 
190 aa  208  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  67.03 
 
 
184 aa  205  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  58.82 
 
 
189 aa  205  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  67.03 
 
 
184 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  58.99 
 
 
187 aa  204  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  58.99 
 
 
187 aa  204  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  58.43 
 
 
187 aa  200  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  55.68 
 
 
186 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  54.44 
 
 
186 aa  195  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  53.26 
 
 
186 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  53.26 
 
 
186 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  54.59 
 
 
187 aa  177  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  54.35 
 
 
185 aa  174  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  54.79 
 
 
198 aa  173  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  52.46 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  47.75 
 
 
185 aa  162  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  50.53 
 
 
185 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  50.81 
 
 
184 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  49.73 
 
 
184 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  49.46 
 
 
184 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  49.73 
 
 
185 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  43.33 
 
 
183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  44.44 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  44.21 
 
 
192 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  48.37 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  39.13 
 
 
194 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  42.7 
 
 
193 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  43.32 
 
 
187 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  40 
 
 
207 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  44.32 
 
 
187 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  47.93 
 
 
197 aa  121  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  44.91 
 
 
187 aa  121  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  44.04 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  40.98 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  42.78 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  42.16 
 
 
187 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  45.21 
 
 
184 aa  117  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  43.78 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  42.27 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  37.3 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  40.82 
 
 
189 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  34.95 
 
 
193 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  41.44 
 
 
209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  44.44 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  41.62 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  39.66 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  31.55 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  44.02 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  37.1 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  43.11 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  41.3 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  34.95 
 
 
190 aa  111  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  45 
 
 
174 aa  111  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  36.56 
 
 
184 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.92 
 
 
191 aa  111  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  37.3 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  35.68 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.92 
 
 
191 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  43.24 
 
 
184 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  41.11 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  39.13 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  32.43 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  38.59 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  35.29 
 
 
215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  42.47 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  42.47 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  40.91 
 
 
192 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  37.22 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  39.34 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  37.36 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  36.11 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  38.92 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  34.44 
 
 
182 aa  108  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  32.43 
 
 
181 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  42.7 
 
 
184 aa  108  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  45.3 
 
 
186 aa  108  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  43.75 
 
 
174 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  35.29 
 
 
215 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  40.22 
 
 
198 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  35.29 
 
 
215 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  29.89 
 
 
186 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  36.07 
 
 
200 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  33.51 
 
 
187 aa  106  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  34.81 
 
 
178 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  34.22 
 
 
199 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>