More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0640 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  56.52 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  50.27 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  49.73 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  51.67 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  50 
 
 		 188 aa  198  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  50.27 
 
 		 188 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  50 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  50 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  50 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  50 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  50 
 
 		 188 aa  197  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  46.77 
 
 		 198 aa  197  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  49.46 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  48.11 
 
 		 188 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  51.11 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  48.9 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  45.05 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  47.54 
 
 		 182 aa  184  9e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1260  N6-adenine-specific methylase  47.59 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  42.31 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  42.54 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  42.86 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  38.67 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  41.71 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  41.71 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  37.36 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  36.07 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  38.67 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  37.57 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  36.76 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  38.67 
 
 		 180 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  36.41 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  34.07 
 
 		 183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  38.8 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  38.8 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  38.67 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  35.56 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  36.76 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  34.81 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  35.48 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.3 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  34.78 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  33.15 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  37.78 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  36.61 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  30.94 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  36.96 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  36.61 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  39.13 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  32.26 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  36.61 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  37.02 
 
 		 178 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  36.61 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  36.61 
 
 		 179 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  34.05 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  32.79 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  37.8 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  35.11 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  30.94 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  37.31 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  30.94 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  32.04 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  34.95 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  30.39 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  31.15 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  32.97 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0207  methyltransferase, putative  37.23 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  33.33 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.34 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.82 
 
 		 220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.82 
 
 		 220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  35.2 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.82 
 
 		 220 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.51 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl194  N6-adenine-specific methylase  43.31 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0361604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.71 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  33.51 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  32.97 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  31.18 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  33.15 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  34.74 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  33.15 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.51 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  33.91 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  33.51 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  35.83 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.51 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.51 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.51 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  33.51 
 
 		 198 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  33.51 
 
 		 198 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  31.02 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  34.04 
 
 		 184 aa  104  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  35.14 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  36.42 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  30.39 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  34.03 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  34.21 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>