More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0218 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  87.05 
 
 		 193 aa  350  8.999999999999999e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  75.39 
 
 		 209 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  73.3 
 
 		 222 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  71.35 
 
 		 195 aa  290  9e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  72.25 
 
 		 221 aa  289  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  73.3 
 
 		 222 aa  288  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  73.3 
 
 		 222 aa  288  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  72.77 
 
 		 222 aa  287  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  71.2 
 
 		 215 aa  283  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  69.43 
 
 		 199 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  70.68 
 
 		 215 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  70.68 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  68.91 
 
 		 191 aa  276  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  70.33 
 
 		 190 aa  269  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  69.19 
 
 		 209 aa  267  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.19 
 
 		 191 aa  214  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  55.67 
 
 		 191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.45 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.44 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  53.44 
 
 		 198 aa  205  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.44 
 
 		 198 aa  205  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.44 
 
 		 198 aa  205  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.44 
 
 		 198 aa  205  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.44 
 
 		 198 aa  205  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.65 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52.91 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  52.91 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  52.91 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.15 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.76 
 
 		 220 aa  201  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.76 
 
 		 220 aa  201  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.76 
 
 		 220 aa  201  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52.11 
 
 		 206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.64 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.64 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.64 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.64 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.64 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  48.68 
 
 		 199 aa  191  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  46.88 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  48.99 
 
 		 200 aa  188  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  47.59 
 
 		 202 aa  187  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  48.4 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  48.9 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  48.9 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  47.94 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  47.42 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  46.96 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  47.8 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  46.35 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  46.7 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  45.26 
 
 		 194 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  47.67 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  46.15 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  47.09 
 
 		 200 aa  174  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  46.15 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  45.79 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  46.28 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  44.75 
 
 		 202 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  45.7 
 
 		 228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  44.62 
 
 		 211 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.81 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  45.16 
 
 		 205 aa  158  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  43.98 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  43.65 
 
 		 192 aa  151  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  43.09 
 
 		 188 aa  148  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  40 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  40 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  39.47 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  41.29 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  39.36 
 
 		 212 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  39.13 
 
 		 192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  39.89 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  40.88 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  40.88 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  39.89 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  41.18 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  37.97 
 
 		 228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  40.76 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  41.4 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  41.76 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  39.34 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  39.46 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  40.21 
 
 		 227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  36.1 
 
 		 228 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  39.36 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  38.42 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  40.21 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  39.38 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  40.21 
 
 		 237 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  39.9 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  40.21 
 
 		 204 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  40.53 
 
 		 198 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  40.54 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0579  putative methyltransferase  39.41 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0747  methyltransferase, putative  39.41 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0468  methyltransferase, putative  40.22 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0799  putative methyltransferase  34.95 
 
 		 242 aa  121  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  37.1 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>