More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0579 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  100 
 
 		 204 aa  403  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  95.1 
 
 		 204 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  80.39 
 
 		 204 aa  331  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  72.68 
 
 		 227 aa  295  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  73.17 
 
 		 204 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  72.68 
 
 		 204 aa  289  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  72.33 
 
 		 204 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  72.33 
 
 		 204 aa  287  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  74.36 
 
 		 237 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0563  putative methyltransferase  72.6 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00400305  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0493  methyltransferase  75.53 
 
 		 204 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0468  methyltransferase, putative  73.56 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0747  methyltransferase, putative  72.6 
 
 		 229 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0579  putative methyltransferase  72.6 
 
 		 208 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344275  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0094  putative methyltransferase  72.12 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3126  methyltransferase, putative  72.12 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1496  putative methyltransferase  72.12 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2924  putative methyltransferase  72.12 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  58.54 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  58.38 
 
 		 210 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  50.23 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  51.71 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  48.83 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1802  methyltransferase  53.89 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1668  hypothetical protein  54.04 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  52.2 
 
 		 179 aa  181  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2840  methyltransferase  56.98 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.964811  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3517  putative methyltransferase  56.91 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  51.63 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  52.74 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  50.75 
 
 		 190 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1281  hypothetical protein  50.26 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  52.46 
 
 		 204 aa  167  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0894  putative methyltransferase  49.52 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3870  putative methyltransferase  52.74 
 
 		 209 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  49.04 
 
 		 318 aa  164  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  48.37 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  43.37 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  41.88 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  42.86 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  47.09 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  44.22 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2735  hypothetical protein  49.44 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.812643  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  47.09 
 
 		 196 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4369  methyltransferase  51.04 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  42.44 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  48.04 
 
 		 208 aa  144  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  42.44 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  42.78 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  48.04 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  43.69 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  42.44 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  62.2 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.96 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  46.15 
 
 		 191 aa  141  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  46.15 
 
 		 191 aa  141  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  45.6 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  45.6 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  37.56 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.16 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.16 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  46.96 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  49.46 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.16 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  45.55 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  45.86 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  42.47 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  42.47 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  43.3 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  39.51 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  43.32 
 
 		 200 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  41.03 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  46 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  42.22 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  40.1 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  43.78 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  40.1 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  40.1 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  42.39 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  42.16 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  37.91 
 
 		 181 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  38.12 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.72 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  43.72 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  41.86 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  41.08 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  38.81 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  40.91 
 
 		 212 aa  130  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  40 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  41.35 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  38.42 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  42.47 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  38.42 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  38.42 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  40.78 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  36.95 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  37.93 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>