More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1281 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1281  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0894  putative methyltransferase  69.72 
 
 
224 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1802  methyltransferase  65 
 
 
236 aa  234  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218305  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1668  hypothetical protein  60.87 
 
 
220 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2840  methyltransferase  67.03 
 
 
207 aa  229  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.964811  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  60.85 
 
 
318 aa  224  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3517  putative methyltransferase  65.93 
 
 
207 aa  224  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  61.8 
 
 
204 aa  221  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4369  methyltransferase  63.64 
 
 
220 aa  218  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3870  putative methyltransferase  61.88 
 
 
209 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  54.26 
 
 
220 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  50.52 
 
 
214 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  50 
 
 
218 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  49.75 
 
 
218 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  51.28 
 
 
215 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  51.1 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  49.21 
 
 
204 aa  170  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  50.26 
 
 
204 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  49.49 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  48.94 
 
 
204 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  48.94 
 
 
227 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  47.96 
 
 
204 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  47.87 
 
 
204 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0468  methyltransferase, putative  44.8 
 
 
229 aa  158  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0747  methyltransferase, putative  50.54 
 
 
229 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0579  putative methyltransferase  50.54 
 
 
208 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344275  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0563  putative methyltransferase  50 
 
 
234 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00400305  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  48.09 
 
 
204 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  48.09 
 
 
237 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1496  putative methyltransferase  50 
 
 
208 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3126  methyltransferase, putative  50 
 
 
208 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0094  putative methyltransferase  50 
 
 
208 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2924  putative methyltransferase  50 
 
 
208 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  48.31 
 
 
190 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  46.49 
 
 
184 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0493  methyltransferase  48.09 
 
 
204 aa  148  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  44.79 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  46.37 
 
 
179 aa  144  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  40.95 
 
 
228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  46.11 
 
 
196 aa  138  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  42.31 
 
 
185 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.93 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  45.24 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.52 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.52 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  45.11 
 
 
205 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  41.99 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  37.7 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  41.49 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.05 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2735  hypothetical protein  41.34 
 
 
179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.812643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  37.57 
 
 
199 aa  126  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  36.9 
 
 
193 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  36.9 
 
 
193 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  45.11 
 
 
192 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  40.88 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.98 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  39.15 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.98 
 
 
191 aa  124  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  37.38 
 
 
201 aa  124  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  40.53 
 
 
200 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  35.5 
 
 
199 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  40.33 
 
 
208 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.3 
 
 
198 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  36.04 
 
 
199 aa  121  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  40.21 
 
 
201 aa  121  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  39.3 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  39.89 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.3 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.3 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.3 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.3 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  40.32 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  39.3 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  38.81 
 
 
198 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.81 
 
 
198 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  37.63 
 
 
216 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.81 
 
 
198 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.81 
 
 
198 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.58 
 
 
199 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.3 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.81 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  52.94 
 
 
203 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  42.57 
 
 
181 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.67 
 
 
198 aa  118  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  42.57 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.41 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  38.04 
 
 
188 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  39.56 
 
 
194 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.54 
 
 
199 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  33.97 
 
 
228 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  35.29 
 
 
203 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.3 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  41.48 
 
 
228 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  35.83 
 
 
199 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  39.01 
 
 
196 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  37.57 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  38.22 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  37.04 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0799  putative methyltransferase  36.84 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>