More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1925 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  82.14 
 
 		 198 aa  328  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  47.09 
 
 		 204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  47.09 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  47.09 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2840  methyltransferase  49.46 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.964811  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  46.56 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  45.5 
 
 		 204 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0493  methyltransferase  48.68 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3517  putative methyltransferase  48.39 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  46.03 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  47.09 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  48.98 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  45.27 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1802  methyltransferase  46.28 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  50.32 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  46.77 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  52.9 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  46.41 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0747  methyltransferase, putative  46.39 
 
 		 229 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0579  putative methyltransferase  46.39 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  49.03 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0468  methyltransferase, putative  46.84 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  54.69 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3126  methyltransferase, putative  45.88 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2924  putative methyltransferase  45.88 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1496  putative methyltransferase  45.88 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0094  putative methyltransferase  45.88 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  43.72 
 
 		 318 aa  137  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  45.99 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  44.15 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0563  putative methyltransferase  45.36 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00400305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3870  putative methyltransferase  47.34 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1668  hypothetical protein  45.74 
 
 		 220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  56 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  43.62 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0894  putative methyltransferase  46.52 
 
 		 224 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  42.71 
 
 		 181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  42.16 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  42.63 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  48.05 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1281  hypothetical protein  45.24 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  43.16 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4369  methyltransferase  43.65 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  42.02 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  38.5 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  43.68 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.45 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  40.93 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  40.93 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  40.93 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.88 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  41.05 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  40.41 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  40.62 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  40.53 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  40.74 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  49.6 
 
 		 199 aa  124  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  44.44 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.41 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.41 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  44.44 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.41 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  44.44 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.41 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  39.68 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  39.68 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  42.16 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.41 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  41.54 
 
 		 209 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  41.58 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.86 
 
 		 191 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.89 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  42.11 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2735  hypothetical protein  39.79 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.812643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  39.15 
 
 		 215 aa  121  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.02 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.62 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  46.41 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  38.83 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  39.7 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  38.5 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  39.57 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.8 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  40 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  40.96 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  40 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  39.49 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  40.1 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.49 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  37.88 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.49 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.49 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.49 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>