More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2808 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  100 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  90.31 
 
 
227 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  99.02 
 
 
204 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  95.1 
 
 
204 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  91.18 
 
 
204 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0493  methyltransferase  90.96 
 
 
204 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0468  methyltransferase, putative  79.25 
 
 
229 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0747  methyltransferase, putative  79.9 
 
 
229 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0579  putative methyltransferase  79.81 
 
 
208 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3126  methyltransferase, putative  79.33 
 
 
208 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1496  putative methyltransferase  79.33 
 
 
208 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0094  putative methyltransferase  79.33 
 
 
208 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2924  putative methyltransferase  79.33 
 
 
208 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0563  putative methyltransferase  78.47 
 
 
234 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00400305  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  72.82 
 
 
204 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  72.33 
 
 
204 aa  289  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  70.24 
 
 
204 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  53.69 
 
 
214 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  50.46 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  54.11 
 
 
210 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  51.17 
 
 
218 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1668  hypothetical protein  50.7 
 
 
220 aa  184  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  51.16 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1802  methyltransferase  51.03 
 
 
236 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218305  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  53.01 
 
 
179 aa  175  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  50.27 
 
 
184 aa  172  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  50.28 
 
 
185 aa  164  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0894  putative methyltransferase  43.66 
 
 
224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2735  hypothetical protein  51.69 
 
 
179 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.812643  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  46.56 
 
 
198 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2840  methyltransferase  52.22 
 
 
207 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.964811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  52.02 
 
 
190 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  49.16 
 
 
204 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1281  hypothetical protein  48.09 
 
 
217 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  47.09 
 
 
196 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  45.96 
 
 
199 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3517  putative methyltransferase  51.11 
 
 
207 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  45.77 
 
 
220 aa  151  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3870  putative methyltransferase  48.34 
 
 
209 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4369  methyltransferase  50.53 
 
 
220 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  43.01 
 
 
199 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  49.25 
 
 
205 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  44.59 
 
 
318 aa  145  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  47.57 
 
 
208 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  47.57 
 
 
208 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  42.93 
 
 
199 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  45.54 
 
 
228 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  43.39 
 
 
202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  44.57 
 
 
188 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  44 
 
 
201 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  44.44 
 
 
191 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  41.92 
 
 
199 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  42.36 
 
 
200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  39.67 
 
 
181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  47.62 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  41.58 
 
 
200 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  39.67 
 
 
181 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  39.02 
 
 
215 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  45.16 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  39.02 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  43.01 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  41.99 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  41.55 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  39.02 
 
 
215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  40.4 
 
 
222 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 
202 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  48.92 
 
 
192 aa  131  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.34 
 
 
191 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.75 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.75 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  41.24 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  41.75 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  40.51 
 
 
222 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  42.44 
 
 
212 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  40.61 
 
 
194 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  40.51 
 
 
222 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  44.97 
 
 
196 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  46.81 
 
 
191 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  40.51 
 
 
222 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.75 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  41.71 
 
 
205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  36.97 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.08 
 
 
207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  40.84 
 
 
200 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  37.91 
 
 
203 aa  128  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  39.44 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  39.44 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  41.05 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  40.1 
 
 
200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  40.1 
 
 
196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.58 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  41.75 
 
 
200 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  40.21 
 
 
193 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  41.33 
 
 
201 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  39.9 
 
 
221 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.65 
 
 
199 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  43.62 
 
 
192 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  44.56 
 
 
228 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  38.83 
 
 
200 aa  121  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>