More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0389 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  77.06 
 
 		 218 aa  331  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  76.61 
 
 		 218 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  53.74 
 
 		 214 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  53.3 
 
 		 204 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  54.03 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  52.56 
 
 		 204 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  51.63 
 
 		 204 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  51.71 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0579  putative methyltransferase  52.31 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0747  methyltransferase, putative  52.31 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0468  methyltransferase, putative  52.78 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  56.91 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  50.7 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3126  methyltransferase, putative  51.85 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0094  putative methyltransferase  51.85 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  50.7 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1496  putative methyltransferase  51.85 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2924  putative methyltransferase  51.85 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  51.16 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  51.71 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0563  putative methyltransferase  51.39 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00400305  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  53.2 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1281  hypothetical protein  51.28 
 
 		 217 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0894  putative methyltransferase  51 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3517  putative methyltransferase  53.89 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2840  methyltransferase  53.37 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.964811  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0493  methyltransferase  53.85 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1802  methyltransferase  53.44 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  48.84 
 
 		 318 aa  171  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1668  hypothetical protein  50.97 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  51.03 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3870  putative methyltransferase  50.47 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  47.37 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  45.64 
 
 		 184 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4369  methyltransferase  51.26 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  50.78 
 
 		 179 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  48.98 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  46.7 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  49.33 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  43.07 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  40.19 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  43.69 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  42.71 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.65 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  42.11 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  42.11 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  38.92 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  40.45 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.3 
 
 		 191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  38.42 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  40.78 
 
 		 199 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.78 
 
 		 191 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.08 
 
 		 199 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  40.47 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  40.83 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  39.46 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.63 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  42.19 
 
 		 199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  40.89 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  40.62 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  45.63 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2735  hypothetical protein  45.7 
 
 		 179 aa  125  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.812643  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  45.76 
 
 		 192 aa  124  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  37.76 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  40.85 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  50 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.03 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.03 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  42.63 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  39.7 
 
 		 191 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.03 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.91 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  39.44 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.78 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  44.03 
 
 		 193 aa  121  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  39.44 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  39.44 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  39.44 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  33.82 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  41.41 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  41.41 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  40.31 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  54.47 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  40.91 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.91 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.91 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.91 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.29 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.91 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  38.2 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  38.82 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.97 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  45.39 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  42.86 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  51.37 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  38.42 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  39.89 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  43.02 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  42.71 
 
 		 196 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>