More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3664 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  100 
 
 
198 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  97.98 
 
 
198 aa  400  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  98.99 
 
 
198 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  98.99 
 
 
198 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  98.48 
 
 
198 aa  400  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  98.48 
 
 
198 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  97.98 
 
 
198 aa  400  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  98.99 
 
 
198 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  98.48 
 
 
198 aa  401  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  85.86 
 
 
207 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  85.86 
 
 
207 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  85.86 
 
 
207 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  85.86 
 
 
207 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  85.86 
 
 
207 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  80.3 
 
 
199 aa  317  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  73.54 
 
 
191 aa  294  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  73.54 
 
 
191 aa  293  8e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  71.5 
 
 
199 aa  290  7e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.56 
 
 
206 aa  289  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.53 
 
 
220 aa  285  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.53 
 
 
220 aa  285  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.53 
 
 
220 aa  284  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  67.91 
 
 
207 aa  268  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  60.64 
 
 
199 aa  244  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  59.47 
 
 
199 aa  244  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  56.92 
 
 
199 aa  235  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  59.04 
 
 
215 aa  223  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  59.04 
 
 
215 aa  222  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  59.04 
 
 
215 aa  222  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  55.44 
 
 
209 aa  222  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  58.6 
 
 
221 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  56.19 
 
 
222 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  59.38 
 
 
199 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  56.19 
 
 
222 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  56.19 
 
 
222 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  55.67 
 
 
222 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  55.61 
 
 
200 aa  217  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  54.69 
 
 
212 aa  213  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  51.74 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  56.45 
 
 
191 aa  211  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  56.83 
 
 
190 aa  210  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  53.44 
 
 
193 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  55.38 
 
 
209 aa  205  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  53.04 
 
 
203 aa  203  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  54.05 
 
 
201 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  53.97 
 
 
193 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  55.08 
 
 
200 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  53.16 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  52.43 
 
 
196 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  49.47 
 
 
194 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  51.03 
 
 
202 aa  194  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  52.08 
 
 
211 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  51.35 
 
 
194 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  51.02 
 
 
200 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  51.61 
 
 
193 aa  190  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  51.61 
 
 
193 aa  190  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  51.63 
 
 
200 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  50.51 
 
 
198 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  51.11 
 
 
196 aa  187  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  52.43 
 
 
200 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  48.94 
 
 
216 aa  181  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  48.91 
 
 
200 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  48.37 
 
 
200 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  48.09 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.21 
 
 
202 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  48.69 
 
 
192 aa  175  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  50.28 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  51.63 
 
 
228 aa  173  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  48.04 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  46.32 
 
 
205 aa  170  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  48.37 
 
 
192 aa  160  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  45.08 
 
 
228 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  41.4 
 
 
205 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  41.21 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  44.92 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  44.39 
 
 
208 aa  145  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  42.7 
 
 
184 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  44.5 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3870  putative methyltransferase  41.58 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  43.09 
 
 
204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  39.56 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  44.44 
 
 
204 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  39.33 
 
 
181 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  44.07 
 
 
203 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  40.78 
 
 
212 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  42.62 
 
 
179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  41.24 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  43.64 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  41.72 
 
 
228 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  39.36 
 
 
190 aa  128  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  46.71 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  41.21 
 
 
204 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2735  hypothetical protein  40.34 
 
 
179 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.812643  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2840  methyltransferase  41.4 
 
 
207 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.964811  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0894  putative methyltransferase  40.78 
 
 
224 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  39.11 
 
 
189 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  39.11 
 
 
189 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  40.91 
 
 
215 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  43.48 
 
 
227 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1281  hypothetical protein  40.22 
 
 
217 aa  121  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>