More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0238 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  100 
 
 		 220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  100 
 
 		 220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  99.55 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  76.14 
 
 		 206 aa  306  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.92 
 
 		 191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.39 
 
 		 191 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.1 
 
 		 199 aa  291  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  69.39 
 
 		 207 aa  289  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.53 
 
 		 198 aa  285  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70 
 
 		 198 aa  281  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  70 
 
 		 198 aa  280  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70 
 
 		 198 aa  280  9e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70 
 
 		 198 aa  280  9e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70 
 
 		 198 aa  280  9e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  70 
 
 		 198 aa  279  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  70 
 
 		 198 aa  279  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  69.47 
 
 		 198 aa  279  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.37 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.37 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.37 
 
 		 207 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.37 
 
 		 207 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.37 
 
 		 207 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  69.68 
 
 		 199 aa  258  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  60.44 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  59.34 
 
 		 199 aa  228  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  58.47 
 
 		 199 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  58.56 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  57.98 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  54.29 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  54.59 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  52.33 
 
 		 200 aa  205  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  50.99 
 
 		 202 aa  204  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  54.11 
 
 		 215 aa  204  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  52.38 
 
 		 203 aa  204  8e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  54.11 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  49.11 
 
 		 221 aa  202  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  52.91 
 
 		 200 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  53.76 
 
 		 193 aa  201  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  57.46 
 
 		 201 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  53.59 
 
 		 200 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  53.59 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  54.4 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  50 
 
 		 211 aa  198  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  55.8 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  49.55 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  49.55 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  49.1 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  49.55 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  55.8 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  53.23 
 
 		 193 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  55.08 
 
 		 190 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  53.04 
 
 		 200 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  53.89 
 
 		 202 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  52.13 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  53.48 
 
 		 200 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  53.59 
 
 		 195 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  49.74 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  53.59 
 
 		 198 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  50.27 
 
 		 196 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  53.04 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  50.79 
 
 		 200 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  47.5 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  51.03 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  51.11 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  50 
 
 		 193 aa  177  9e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  50 
 
 		 193 aa  177  9e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  49.73 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  50.28 
 
 		 188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.19 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  46.59 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  47.06 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  44.5 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  43.62 
 
 		 208 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  44.15 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  46.89 
 
 		 185 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  42.23 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  44.67 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  42.61 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  43.75 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  42.05 
 
 		 181 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  46.11 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  44.2 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  40.51 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  45.16 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  42.42 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  43.23 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  43.26 
 
 		 189 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  43.26 
 
 		 189 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  42.47 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3870  putative methyltransferase  43.5 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  39.23 
 
 		 179 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  40.31 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  41.26 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  39.45 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  42.03 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  42.03 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  39.35 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  43.15 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1281  hypothetical protein  40.21 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>