More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2754 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  43.89 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  43.33 
 
 
200 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  43.33 
 
 
200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.26 
 
 
220 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.26 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  40.66 
 
 
205 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.26 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  38.67 
 
 
181 aa  131  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  38.12 
 
 
181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.82 
 
 
206 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.26 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  40.66 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  42.78 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  39.66 
 
 
199 aa  127  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  38.46 
 
 
199 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.7 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  39.11 
 
 
199 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.78 
 
 
207 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  42.22 
 
 
194 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  43.5 
 
 
190 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  43.26 
 
 
205 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  43.01 
 
 
192 aa  123  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.11 
 
 
198 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  43.33 
 
 
201 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  44.44 
 
 
228 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  41.11 
 
 
196 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  44.51 
 
 
228 aa  121  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  42.78 
 
 
200 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  42.78 
 
 
198 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  41.58 
 
 
196 aa  120  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.01 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  45.5 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  44.51 
 
 
192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.55 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  44.97 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  38.55 
 
 
198 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.55 
 
 
198 aa  118  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.55 
 
 
198 aa  118  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.55 
 
 
198 aa  118  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.55 
 
 
198 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  38.55 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  47.74 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  38.55 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  39.87 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.89 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2735  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.812643  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  37.57 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  40.22 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  40.33 
 
 
201 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  38.71 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  38.33 
 
 
222 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  35.91 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  35.75 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  39.56 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  39.89 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  37.84 
 
 
222 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  38.33 
 
 
221 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  37.84 
 
 
222 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  37.84 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  38.75 
 
 
207 aa  111  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  36.61 
 
 
200 aa  111  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  37.91 
 
 
189 aa  111  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  36.36 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  36.36 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  37.16 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  38.89 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  35.79 
 
 
212 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.34 
 
 
202 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  39.23 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  37.3 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.99 
 
 
207 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  40.56 
 
 
200 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  38.67 
 
 
216 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.99 
 
 
207 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.99 
 
 
207 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.99 
 
 
207 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  37.7 
 
 
190 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.99 
 
 
207 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  40.11 
 
 
214 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  38.8 
 
 
191 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  35.83 
 
 
215 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  35.83 
 
 
215 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  36.41 
 
 
215 aa  104  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  52.89 
 
 
188 aa  104  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  37.75 
 
 
178 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  42.31 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  42.31 
 
 
237 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  34.64 
 
 
180 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  34.64 
 
 
180 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  35.68 
 
 
193 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  35.83 
 
 
193 aa  101  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  42.39 
 
 
204 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  37.25 
 
 
186 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  43.48 
 
 
204 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0894  putative methyltransferase  37.89 
 
 
224 aa  100  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  41.08 
 
 
203 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0579  putative methyltransferase  45.96 
 
 
208 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344275  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0094  putative methyltransferase  45.96 
 
 
208 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>