More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0337 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  427  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  80.09 
 
 
210 aa  322  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  58.25 
 
 
204 aa  214  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  58.54 
 
 
204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  53.95 
 
 
218 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  51.9 
 
 
218 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  53.69 
 
 
204 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  54.68 
 
 
227 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  54.68 
 
 
204 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  53.69 
 
 
204 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  53.74 
 
 
215 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  57.56 
 
 
204 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  53.69 
 
 
204 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  53.85 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0468  methyltransferase, putative  54.76 
 
 
229 aa  191  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0579  putative methyltransferase  54.9 
 
 
208 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0747  methyltransferase, putative  54.07 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1281  hypothetical protein  50.52 
 
 
217 aa  188  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3126  methyltransferase, putative  54.41 
 
 
208 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2924  putative methyltransferase  54.41 
 
 
208 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0094  putative methyltransferase  54.41 
 
 
208 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1496  putative methyltransferase  54.41 
 
 
208 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0563  putative methyltransferase  53.11 
 
 
234 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00400305  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  51.69 
 
 
220 aa  181  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0493  methyltransferase  51.87 
 
 
204 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1802  methyltransferase  50.53 
 
 
236 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218305  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  53.63 
 
 
204 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  51.1 
 
 
185 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0894  putative methyltransferase  46.83 
 
 
224 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  51.11 
 
 
179 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1668  hypothetical protein  47.87 
 
 
220 aa  167  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2840  methyltransferase  53.23 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.964811  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3517  putative methyltransferase  52.69 
 
 
207 aa  165  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4764  hypothetical protein  49.48 
 
 
318 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  48.07 
 
 
184 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  46.28 
 
 
199 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3870  putative methyltransferase  54.19 
 
 
209 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  52.15 
 
 
205 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  43.88 
 
 
202 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  51.1 
 
 
190 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4369  methyltransferase  48.72 
 
 
220 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  41.67 
 
 
193 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  41.67 
 
 
193 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  41.53 
 
 
199 aa  154  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  43.01 
 
 
199 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  42.33 
 
 
191 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  44.57 
 
 
199 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  44.93 
 
 
211 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  39.46 
 
 
212 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2735  hypothetical protein  48.09 
 
 
179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.812643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.25 
 
 
191 aa  145  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  41.27 
 
 
209 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  45.83 
 
 
196 aa  145  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  43.78 
 
 
188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.67 
 
 
220 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.25 
 
 
191 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  50.32 
 
 
196 aa  144  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.67 
 
 
220 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.67 
 
 
220 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  38.21 
 
 
216 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  49.68 
 
 
198 aa  142  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  40.98 
 
 
181 aa  141  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  39.47 
 
 
193 aa  141  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  40.48 
 
 
209 aa  141  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  44.5 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  44.5 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.5 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  37.95 
 
 
222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  40.98 
 
 
181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  41.03 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  38.42 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  44.5 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.45 
 
 
199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.5 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.5 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.5 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.5 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.5 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  36.82 
 
 
215 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  44.5 
 
 
228 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  42.31 
 
 
194 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  39.46 
 
 
200 aa  137  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  36.82 
 
 
215 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  35.38 
 
 
221 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  37.24 
 
 
222 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.92 
 
 
207 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.78 
 
 
206 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.92 
 
 
207 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.92 
 
 
207 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  37.24 
 
 
222 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.92 
 
 
207 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  37.24 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  37.08 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  38.31 
 
 
229 aa  135  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.39 
 
 
207 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.92 
 
 
207 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  36.36 
 
 
215 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  43.22 
 
 
201 aa  134  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  40.54 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  47.28 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>