More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4066 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  100 
 
 
207 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  82.65 
 
 
199 aa  334  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  80.31 
 
 
191 aa  314  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  79.27 
 
 
191 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  69.39 
 
 
220 aa  289  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  69.39 
 
 
220 aa  289  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  69.39 
 
 
220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  67.91 
 
 
198 aa  268  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.68 
 
 
206 aa  268  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  66.67 
 
 
198 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  67.91 
 
 
198 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  67.91 
 
 
198 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  67.91 
 
 
198 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  67.91 
 
 
198 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  67.38 
 
 
198 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  67.38 
 
 
198 aa  263  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  67.38 
 
 
198 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.88 
 
 
199 aa  247  8e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  67.71 
 
 
207 aa  247  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  67.19 
 
 
207 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  67.19 
 
 
207 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  67.19 
 
 
207 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  67.19 
 
 
207 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  57.65 
 
 
199 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  56.84 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  56.91 
 
 
199 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  57.07 
 
 
202 aa  218  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  57.45 
 
 
199 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  55.84 
 
 
215 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  56.84 
 
 
215 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  56.91 
 
 
199 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  53.3 
 
 
222 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  53.3 
 
 
222 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  53.3 
 
 
222 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  60.77 
 
 
191 aa  214  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  55.05 
 
 
221 aa  214  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  55.61 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  54.21 
 
 
209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  54.69 
 
 
190 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  54.44 
 
 
200 aa  209  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  56.15 
 
 
209 aa  208  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  53.65 
 
 
193 aa  204  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  53.3 
 
 
212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  54.74 
 
 
195 aa  197  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  49.47 
 
 
203 aa  197  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  53.37 
 
 
193 aa  197  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  55.49 
 
 
201 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  52.69 
 
 
200 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  54.4 
 
 
196 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  53.85 
 
 
200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  50.78 
 
 
200 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  50.78 
 
 
200 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  53.3 
 
 
194 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  50 
 
 
194 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  52.17 
 
 
198 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  51.61 
 
 
202 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  51.91 
 
 
211 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  50.26 
 
 
200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  50.79 
 
 
200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  50 
 
 
200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  48.33 
 
 
193 aa  181  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  48.33 
 
 
193 aa  181  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  49.73 
 
 
205 aa  180  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  47.12 
 
 
216 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  51.69 
 
 
196 aa  180  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  52.36 
 
 
228 aa  175  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  49.44 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  50.82 
 
 
192 aa  171  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  50.28 
 
 
188 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  50 
 
 
192 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  48.09 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.31 
 
 
202 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  45.88 
 
 
208 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  46.94 
 
 
208 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  46.43 
 
 
228 aa  155  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  45.05 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  45.96 
 
 
204 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  45.18 
 
 
204 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  42.7 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  42.13 
 
 
181 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  44.51 
 
 
184 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  45 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  44.92 
 
 
214 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  40.84 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  40.93 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  42.55 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  43.65 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  41.5 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  41.54 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  40.88 
 
 
179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  45.74 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  45.08 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  41.45 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  41.71 
 
 
218 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  45.6 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  45.08 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0493  methyltransferase  42.02 
 
 
204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  45.08 
 
 
204 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  43.11 
 
 
229 aa  127  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  44.44 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>