More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3841 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  100 
 
 		 207 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  100 
 
 		 207 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  100 
 
 		 207 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  99.52 
 
 		 207 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  99.52 
 
 		 207 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  86.87 
 
 		 198 aa  364  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  86.36 
 
 		 198 aa  362  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  86.36 
 
 		 198 aa  362  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  86.36 
 
 		 198 aa  362  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  85.86 
 
 		 198 aa  362  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  85.86 
 
 		 198 aa  361  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  85.86 
 
 		 198 aa  360  8e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  85.35 
 
 		 198 aa  360  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  85.35 
 
 		 198 aa  360  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  84.34 
 
 		 199 aa  325  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.53 
 
 		 191 aa  293  9e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.53 
 
 		 191 aa  293  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.37 
 
 		 220 aa  280  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.37 
 
 		 220 aa  280  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  69.54 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.53 
 
 		 199 aa  280  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  70.37 
 
 		 220 aa  280  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  65.67 
 
 		 207 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  63.68 
 
 		 199 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  63.83 
 
 		 199 aa  254  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  59.78 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  60.64 
 
 		 215 aa  228  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  60.64 
 
 		 215 aa  227  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  61.2 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  60.11 
 
 		 215 aa  225  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  57.35 
 
 		 222 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  57.14 
 
 		 222 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  57.35 
 
 		 222 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  57.35 
 
 		 222 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  56.48 
 
 		 209 aa  221  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  55.98 
 
 		 200 aa  216  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  57.92 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  53.72 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  57.3 
 
 		 199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  57.44 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  54.64 
 
 		 193 aa  208  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  52.11 
 
 		 212 aa  208  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  56.83 
 
 		 191 aa  205  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  55.43 
 
 		 193 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  51.93 
 
 		 203 aa  201  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  54.01 
 
 		 200 aa  201  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  56.35 
 
 		 195 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  50.52 
 
 		 194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  52.26 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  52.76 
 
 		 200 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  52.69 
 
 		 193 aa  194  7e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  52.69 
 
 		 193 aa  194  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  52.43 
 
 		 194 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  52.43 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  51.55 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  52.46 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  48.94 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  50 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  50.51 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  50.82 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  49.73 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  44.16 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  48.63 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  48.63 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  47.12 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  47.12 
 
 		 192 aa  171  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.64 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  43.72 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  51.35 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  49.72 
 
 		 188 aa  167  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  47.8 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  44.56 
 
 		 228 aa  150  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  41.15 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  45.21 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  45.21 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  42.36 
 
 		 214 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  41.08 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3870  putative methyltransferase  44.92 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  41.21 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  40.33 
 
 		 181 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  41.4 
 
 		 184 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  43.59 
 
 		 203 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  45.45 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  39.8 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  42.38 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  48.68 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  41.97 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  41.18 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2840  methyltransferase  43.59 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.964811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1802  methyltransferase  41.62 
 
 		 236 aa  128  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  43.17 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  39.77 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  42.42 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  38.83 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1281  hypothetical protein  39.9 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2735  hypothetical protein  40.91 
 
 		 179 aa  125  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.812643  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3517  putative methyltransferase  42.78 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  41.45 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  38.66 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  41.58 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>