More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0173 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  100 
 
 
203 aa  394  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  49.74 
 
 
196 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  43.48 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  49.47 
 
 
228 aa  150  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  50 
 
 
205 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  48 
 
 
204 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.54 
 
 
206 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  42.21 
 
 
199 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.75 
 
 
220 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.75 
 
 
220 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.75 
 
 
220 aa  147  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  42.39 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  48.17 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.9 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.9 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  48.69 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  49.48 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44 
 
 
199 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  42.39 
 
 
199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  49.48 
 
 
204 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  47.09 
 
 
188 aa  141  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  48.17 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  37.76 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  45.9 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  49.08 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  47.34 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.48 
 
 
198 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  47.42 
 
 
204 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  47.42 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  41.94 
 
 
191 aa  138  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  45.9 
 
 
196 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.37 
 
 
202 aa  137  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  47.4 
 
 
204 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  43.48 
 
 
198 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  43.48 
 
 
198 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.59 
 
 
207 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  46.03 
 
 
192 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.59 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.59 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.59 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  41.11 
 
 
200 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.93 
 
 
198 aa  135  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.93 
 
 
198 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  42.93 
 
 
198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  43.9 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.93 
 
 
198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.93 
 
 
198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  40.31 
 
 
212 aa  134  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.5 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.08 
 
 
207 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.39 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3126  methyltransferase, putative  47.12 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  43.78 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2924  putative methyltransferase  47.12 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0747  methyltransferase, putative  47.12 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  44.5 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0094  putative methyltransferase  47.12 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0579  putative methyltransferase  47.12 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1496  putative methyltransferase  47.12 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0468  methyltransferase, putative  46.6 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  40.19 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  44.5 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.39 
 
 
199 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  35.98 
 
 
200 aa  132  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  38.42 
 
 
199 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0563  putative methyltransferase  46.6 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00400305  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0493  methyltransferase  48.39 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  43.9 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  42.19 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  43.16 
 
 
201 aa  131  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  37.57 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  43 
 
 
198 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  44 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  44.17 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  39.36 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  47.87 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  44.17 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  44.17 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  41.21 
 
 
211 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  44.52 
 
 
215 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  44.52 
 
 
215 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  48.24 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  40.11 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  47.65 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  43.87 
 
 
215 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  45.26 
 
 
192 aa  128  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  44.94 
 
 
195 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  39.13 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  45.81 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  39.13 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  42.21 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1281  hypothetical protein  46.43 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  43 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  50.66 
 
 
210 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  43.79 
 
 
190 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  39.36 
 
 
193 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  48.37 
 
 
185 aa  124  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  39.08 
 
 
181 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  39.08 
 
 
181 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  46.11 
 
 
218 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>