More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4987 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  99 
 
 		 200 aa  406  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  97 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  93 
 
 		 200 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  68.91 
 
 		 196 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  67.34 
 
 		 201 aa  272  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  67.36 
 
 		 194 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  65.33 
 
 		 200 aa  270  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  64.29 
 
 		 198 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  66.31 
 
 		 200 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  61.14 
 
 		 202 aa  255  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.59 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.59 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.59 
 
 		 220 aa  201  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.59 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.59 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  51.26 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52.49 
 
 		 199 aa  191  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  50.78 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  49.21 
 
 		 222 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  48.13 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  49.74 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  49.73 
 
 		 191 aa  185  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  49.21 
 
 		 222 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  49.21 
 
 		 222 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  49.21 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  48.69 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  46.32 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  43.16 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.09 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  47.06 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.83 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.83 
 
 		 198 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  47.06 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  47.06 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  47.83 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.83 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.83 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  46.88 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  48.31 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.28 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  46.15 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  47.92 
 
 		 199 aa  175  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  49.44 
 
 		 195 aa  174  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  47.54 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  47.54 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  48.07 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  50.84 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  43.65 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  43.98 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  45.64 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  46.41 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  43.89 
 
 		 193 aa  165  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  43.89 
 
 		 193 aa  165  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  45.08 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  46.67 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  45.41 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.63 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.63 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.63 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.63 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  48.63 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  47.54 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  47.54 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  47.49 
 
 		 205 aa  157  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  46.74 
 
 		 228 aa  157  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  47.51 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  44.97 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  44.94 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  46.56 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  45.41 
 
 		 228 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  39.9 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  42.49 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  40.66 
 
 		 194 aa  148  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  42.44 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  41.58 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  41.26 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  43.89 
 
 		 184 aa  141  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  40.78 
 
 		 181 aa  141  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  40.22 
 
 		 181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  44.32 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  44.17 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1496  putative methyltransferase  43.2 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3126  methyltransferase, putative  43.2 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  40.8 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  41.58 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2924  putative methyltransferase  43.2 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0094  putative methyltransferase  43.2 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  40.1 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0563  putative methyltransferase  42.51 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00400305  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  41.58 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0747  methyltransferase, putative  43.2 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0579  putative methyltransferase  43.2 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344275  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  43.33 
 
 		 189 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  43.33 
 
 		 189 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  40.59 
 
 		 227 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  41.34 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0468  methyltransferase, putative  43.2 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  41.45 
 
 		 237 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>