More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3607 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  71.88 
 
 		 193 aa  290  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  71.35 
 
 		 193 aa  290  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  69.68 
 
 		 209 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  71.66 
 
 		 222 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  70.9 
 
 		 222 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  70.9 
 
 		 222 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  70.37 
 
 		 222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  67.19 
 
 		 221 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  71.66 
 
 		 209 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  67.2 
 
 		 215 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  66.67 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  66.67 
 
 		 215 aa  262  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  67.02 
 
 		 191 aa  259  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  63.68 
 
 		 199 aa  254  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  66.12 
 
 		 190 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  58.56 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  58.56 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  58.82 
 
 		 199 aa  204  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.97 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  51.89 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  52.33 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.74 
 
 		 207 aa  197  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.16 
 
 		 198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.16 
 
 		 198 aa  195  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  53.16 
 
 		 198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.16 
 
 		 198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.16 
 
 		 198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.16 
 
 		 198 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52.63 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.35 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.35 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.35 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.04 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.04 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  52.63 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  52.63 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  50.54 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.59 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.59 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.59 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  49.16 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  50.77 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  50.54 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  53.59 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  50.79 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  48.96 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  48.44 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  46.32 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  49.44 
 
 		 200 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  48.89 
 
 		 200 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  49.44 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  49.44 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  48.89 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  47.78 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  48.33 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  47.78 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  46.37 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  44.27 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  45.6 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  45.36 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  47.25 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  44.39 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  44.5 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  42.22 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  42.22 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  46.41 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  42.25 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  44.69 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  43.55 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  42.47 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  42.54 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  43.65 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  42.54 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  43.17 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  41.57 
 
 		 181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  38.35 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  41.01 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  41.85 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  39.15 
 
 		 212 aa  127  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  42.14 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  42.31 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  44.33 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  39.46 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  44.94 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  39.89 
 
 		 179 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  40.43 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  43.15 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  42.86 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  43.88 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  39.36 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  43.08 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  43.88 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  39.7 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1668  hypothetical protein  46.27 
 
 		 220 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6138  hypothetical protein  41.79 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0493  methyltransferase  42.55 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  47.93 
 
 		 218 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>