More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0413 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0413  methylase  100 
 
 		 200 aa  415  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  55.94 
 
 		 212 aa  221  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  56.63 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  57.61 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.63 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.63 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.63 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  55.61 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  56.12 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  56.12 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.12 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.11 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.44 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  53.77 
 
 		 203 aa  208  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  55.56 
 
 		 191 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  55.98 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  55.98 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  55.98 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  55.98 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  55.98 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52.33 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52.33 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  52.33 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  57.07 
 
 		 199 aa  205  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  55 
 
 		 199 aa  204  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  53.97 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  51.76 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  56.35 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  52.58 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  52.58 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  54.64 
 
 		 199 aa  198  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  52.58 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  52.58 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  54.26 
 
 		 191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  52.58 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  52.41 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  50.25 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  52.94 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  52.41 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  48.98 
 
 		 202 aa  194  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  51.52 
 
 		 193 aa  193  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  51.03 
 
 		 199 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  54.44 
 
 		 190 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  53.01 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  50.77 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  48.99 
 
 		 193 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  50.27 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  50.27 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  49.18 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.13 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  44.79 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  44.92 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  44.5 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  43.98 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  46.5 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  43.23 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  42.27 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  44.62 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  46.52 
 
 		 205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  44.26 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  39.04 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  43.78 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  44.2 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  41.94 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  40.59 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  43.65 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  43.17 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  42.08 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  39.89 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  40.21 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  42.27 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  38.69 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  41.67 
 
 		 181 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  37.63 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  141  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  39.46 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  37.5 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  37.5 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  38.54 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  35.96 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  36.95 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  38.64 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  35.98 
 
 		 203 aa  128  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  39.31 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1802  methyltransferase  40.32 
 
 		 236 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  35.08 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  39.05 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  37.58 
 
 		 178 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  39.01 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  38.42 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  37 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1668  hypothetical protein  43.84 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0747  methyltransferase, putative  36.41 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2924  putative methyltransferase  36.59 
 
 		 208 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3126  methyltransferase, putative  36.59 
 
 		 208 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1496  putative methyltransferase  36.59 
 
 		 208 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0094  putative methyltransferase  36.59 
 
 		 208 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0579  putative methyltransferase  36.59 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344275  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  40.98 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0563  putative methyltransferase  36.41 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00400305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>