More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1274 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  92.97 
 
 		 187 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  86.81 
 
 		 188 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  83.52 
 
 		 184 aa  310  6.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  84.62 
 
 		 188 aa  300  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  80.22 
 
 		 184 aa  297  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  80.98 
 
 		 184 aa  288  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  66.85 
 
 		 183 aa  241  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  64.44 
 
 		 185 aa  231  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  63.39 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  59.78 
 
 		 185 aa  218  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  54.64 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  54.64 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  54.1 
 
 		 187 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  57.84 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  52.46 
 
 		 186 aa  197  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  53.85 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  53.59 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  55.03 
 
 		 189 aa  190  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  50.55 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  57.61 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  57.61 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  54.89 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  48.88 
 
 		 190 aa  177  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  50.55 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  48.63 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  51.7 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  49.2 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  47.98 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  50.27 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  49.73 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  49.73 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  49.2 
 
 		 184 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  47.06 
 
 		 184 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  49.21 
 
 		 185 aa  147  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  43.16 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  45.26 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  43.39 
 
 		 207 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  43.08 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  43.85 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  44.44 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  42.25 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  42.41 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.8 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  41.49 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  43.55 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  41.18 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  42.44 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  41.36 
 
 		 191 aa  121  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  41.76 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  43.01 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  42.33 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  43.58 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  36.7 
 
 		 194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.68 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  40.13 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  41.3 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.1 
 
 		 191 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  45.2 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  41.62 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  40.66 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  42.42 
 
 		 228 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  38.8 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  37.36 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  40.98 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  39.44 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  40.68 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  41.38 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  40.21 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  42.31 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  42.31 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  41.14 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  36.11 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  35.48 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  41.57 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  40.83 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  34.95 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  34.95 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  44.74 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  47.73 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  34.05 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  38.42 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.88 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  40.44 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  36.42 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  43.51 
 
 		 203 aa  107  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  35.68 
 
 		 191 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  32.42 
 
 		 200 aa  107  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  42.54 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  39.34 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  40.25 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  41.76 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  37.21 
 
 		 209 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  40.25 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  34.07 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  39.41 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  44.08 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  41.81 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  40.25 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.25 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>